Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm38163-201ENSMUST00000194112 482 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm43144-201ENSMUST00000198256 485 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm44138-201ENSMUST00000204939 271 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm33962-202ENSMUST00000205195 630 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 AC132384.5-201ENSMUST00000218562 226 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm5750-201ENSMUST00000218711 801 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 AC105169.1-201ENSMUST00000218912 1294 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 AC099934.5-201ENSMUST00000222699 945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 CT025552.2-201ENSMUST00000225497 317 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Defa26-201ENSMUST00000074343 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Spink12-201ENSMUST00000081271 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 n-R5s27-201ENSMUST00000093699 119 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Vmn1r9-202ENSMUST00000227399 6778 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Vmn1r167-202ENSMUST00000227713 2677 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Rbm41-202ENSMUST00000087400 2229 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Olfr461-202ENSMUST00000215009 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Olfr1260-202ENSMUST00000111512 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Serpina6-201ENSMUST00000044159 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Ugt8a-203ENSMUST00000198610 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 BB019430-202ENSMUST00000218015 1320 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm43009-201ENSMUST00000199979 3566 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Olfr448-202ENSMUST00000213952 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Ccdc144b-203ENSMUST00000200469 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Rif1-201ENSMUST00000112693 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Nop58-215ENSMUST00000191142 9507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Hgf-204ENSMUST00000199581 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Vmn1r173-203ENSMUST00000227987 9233 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Trav10-201ENSMUST00000103583 406 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm11510-201ENSMUST00000120278 347 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm14656-201ENSMUST00000120342 502 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm12711-201ENSMUST00000131249 340 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Rpl39-ps-201ENSMUST00000142604 355 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm24961-201ENSMUST00000157918 184 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm15740-201ENSMUST00000159703 1292 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 H2al2c-201ENSMUST00000163651 336 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 H2al2b-201ENSMUST00000168551 336 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm29065-201ENSMUST00000188786 487 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm38166-201ENSMUST00000191660 471 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Olfr1409-ps1-201ENSMUST00000194013 252 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm32554-201ENSMUST00000196310 970 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm43370-201ENSMUST00000196437 284 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm8874-201ENSMUST00000196826 286 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm45007-201ENSMUST00000206237 366 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm44650-201ENSMUST00000206929 194 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 4930505K13Rik-201ENSMUST00000208641 546 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 AC159821.1-201ENSMUST00000214934 248 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 AC154241.1-201ENSMUST00000223952 356 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Anxa10-202ENSMUST00000034054 1222 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Vmn1r54-201ENSMUST00000058039 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Acer3-201ENSMUST00000033020 11340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Ktn1-219ENSMUST00000190182 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Casp1-201ENSMUST00000027015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 4930533I22Rik-201ENSMUST00000176290 2564 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Zfp426-201ENSMUST00000080386 2417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Ranbp3l-201ENSMUST00000053308 3017 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 AC154329.1-201ENSMUST00000224408 3129 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Slfn14-201ENSMUST00000163961 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Olfr629-203ENSMUST00000216300 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Cfap97-206ENSMUST00000164504 4521 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Ktn1-216ENSMUST00000189533 3941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 AY512915-203ENSMUST00000159937 3650 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Lpar4-201ENSMUST00000060576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Lrrtm4-202ENSMUST00000126005 3733 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm15737-201ENSMUST00000113434 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm22473-201ENSMUST00000104114 132 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm12994-201ENSMUST00000119601 447 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Amd-ps1-201ENSMUST00000120127 994 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm12005-201ENSMUST00000121451 379 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm22613-201ENSMUST00000122679 292 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm6542-201ENSMUST00000153606 772 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm23354-201ENSMUST00000158426 104 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm22326-201ENSMUST00000158897 351 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm3077-201ENSMUST00000165903 627 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Lgals1-ps1-201ENSMUST00000173500 368 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Rab26os-202ENSMUST00000176921 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm6223-201ENSMUST00000178436 871 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm8919-201ENSMUST00000182028 1014 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Pinc-202ENSMUST00000190487 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Clec2g-205ENSMUST00000203405 967 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm33626-201ENSMUST00000206790 828 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Abca15-204ENSMUST00000207220 567 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm18462-201ENSMUST00000208112 417 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Olfr574-202ENSMUST00000211329 1039 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm26330-201ENSMUST00000082817 104 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Olfr877-202ENSMUST00000213956 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 BC055308-201ENSMUST00000193380 2538 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm28710-202ENSMUST00000211738 2987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm42528-201ENSMUST00000200697 3418 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Olfr1493-ps1-202ENSMUST00000208667 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Gm37018-201ENSMUST00000192441 3869 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Ago2-201ENSMUST00000044113 13705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Ppig-202ENSMUST00000090858 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Enox2-201ENSMUST00000033437 3170 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd10P28359 Cnot4-207ENSMUST00000202417 3296 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms