Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Mrgprb9-ps-201ENSMUST00000188739 892 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ldb2O55203 1700031M16Rik-207ENSMUST00000191513 847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ldb2O55203 Gm8861-201ENSMUST00000196346 832 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ldb2O55203 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ldb2O55203 Gm4602-201ENSMUST00000203198 308 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ldb2O55203 Olfr1468-ps1-201ENSMUST00000207287 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ldb2O55203 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ldb2O55203 Gm18850-201ENSMUST00000211578 388 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ldb2O55203 Olfr1303-202ENSMUST00000216114 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ldb2O55203 AC159619.1-201ENSMUST00000219118 318 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ldb2O55203 Gm20368-201ENSMUST00000220716 301 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ldb2O55203 CT030254.3-201ENSMUST00000225959 1231 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ldb2O55203 Defb10-201ENSMUST00000054162 298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
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Ldb2O55203 Snord59a-201ENSMUST00000082844 74 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ldb2O55203 Gm5152-202ENSMUST00000088625 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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Ldb2O55203 Gm904-201ENSMUST00000099519 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
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Ldb2O55203 Acsl4-204ENSMUST00000112907 5137 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
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Ldb2O55203 Taok1-201ENSMUST00000017435 11813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Ldb2O55203 Slamf7-203ENSMUST00000192195 3975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Ldb2O55203 Cpne4-202ENSMUST00000077190 3409 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Ldb2O55203 Olfr586-204ENSMUST00000215304 6169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Ldb2O55203 Gm12289-201ENSMUST00000130860 2235 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Ldb2O55203 Gm42615-201ENSMUST00000197704 1820 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ldb2O55203 Fam83b-201ENSMUST00000098546 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Ldb2O55203 Clk4-202ENSMUST00000109111 1427 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Ldb2O55203 Bclaf1-201ENSMUST00000043881 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Ldb2O55203 Olfr427-202ENSMUST00000213832 3866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Ldb2O55203 Gm11867-201ENSMUST00000133363 1909 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Ldb2O55203 Gm10488-201ENSMUST00000101657 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Ldb2O55203 Gm25419-201ENSMUST00000104215 191 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ldb2O55203 Gm11020-201ENSMUST00000109447 186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Ldb2O55203 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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Ldb2O55203 Gm10487-202ENSMUST00000180344 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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Ldb2O55203 Spink13-201ENSMUST00000097557 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Ldb2O55203 Zscan4b-201ENSMUST00000168158 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
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Ldb2O55203 Gm21854-202ENSMUST00000190391 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Ldb2O55203 Gm5460-201ENSMUST00000100719 1903 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ldb2O55203 Zscan4-ps3-201ENSMUST00000210559 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ldb2O55203 Zfp780b-204ENSMUST00000206685 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ldb2O55203 Gm42869-201ENSMUST00000199953 2121 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ldb2O55203 Il22ra2-201ENSMUST00000036564 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ldb2O55203 Olfr733-202ENSMUST00000214372 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ldb2O55203 Zzz3-204ENSMUST00000106103 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ldb2O55203 Trav2-201ENSMUST00000103568 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ldb2O55203 Defb42-202ENSMUST00000111203 567 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ldb2O55203 Gm11550-201ENSMUST00000118210 699 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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