Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Gm44518-201ENSMUST00000208080 4370 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Vmn1r196-204ENSMUST00000228382 6525 ntAPPRIS P2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 AC102431.1-201ENSMUST00000223773 1449 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Clvs1-202ENSMUST00000108348 3526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Nlrp5-202ENSMUST00000086341 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Zfp182-202ENSMUST00000115333 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Ubtfl1-203ENSMUST00000169398 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Kif20b-203ENSMUST00000223907 5423 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Tnrc6b-201ENSMUST00000067689 17332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Aspn-201ENSMUST00000021820 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Stxbp4-207ENSMUST00000143203 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Epha7-203ENSMUST00000108191 6615 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Olfr461-202ENSMUST00000215009 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 AC158115.2-201ENSMUST00000221804 5563 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Olfr586-204ENSMUST00000215304 6169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Olfr843-203ENSMUST00000214267 7071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Slc10a2-201ENSMUST00000023835 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Gm16106-201ENSMUST00000119187 294 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Gm11484-201ENSMUST00000119808 338 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Cmc4-202ENSMUST00000120286 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Gm14725-201ENSMUST00000120324 828 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Gm13132-201ENSMUST00000121194 472 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Olfr343-ps1-201ENSMUST00000121883 303 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Gm15290-201ENSMUST00000132880 577 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 4930570N18Rik-201ENSMUST00000159273 332 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Gm26828-201ENSMUST00000180640 172 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Gm28859-201ENSMUST00000186650 616 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Stk-ps2-204ENSMUST00000187808 616 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Gm36997-201ENSMUST00000195090 707 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Igkv12-40-201ENSMUST00000199208 347 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Gm18011-201ENSMUST00000203717 565 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Gm34224-201ENSMUST00000204606 364 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 AC122305.3-201ENSMUST00000214762 361 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Olfr346-201ENSMUST00000078854 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 mt-Nd1-201ENSMUST00000082392 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 4930567H17Rik-201ENSMUST00000092405 840 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Fam83b-201ENSMUST00000098546 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Olfr979-202ENSMUST00000215523 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Olfr1535-202ENSMUST00000217519 3959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Gm4541-201ENSMUST00000208901 1848 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Evi2-202ENSMUST00000170422 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Gm4166-201ENSMUST00000220893 2996 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Pih1d3-201ENSMUST00000027230 1451 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Vmn2r29-201ENSMUST00000170922 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Gm3962-201ENSMUST00000173027 2587 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Gm43154-208ENSMUST00000209658 1442 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Gm37115-201ENSMUST00000193750 2849 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Lin7c-201ENSMUST00000028583 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Cep57l1-201ENSMUST00000019951 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Gm37099-201ENSMUST00000191902 3451 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Vmn1r6-207ENSMUST00000228285 7950 ntAPPRIS P2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Nxf2-203ENSMUST00000113189 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Gm37607-201ENSMUST00000194925 2623 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Scimp-202ENSMUST00000108534 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Gm12704-201ENSMUST00000119789 464 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Gm26352-201ENSMUST00000158223 125 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Esp1-201ENSMUST00000161110 1049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Vmn1r5-201ENSMUST00000164307 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Gm25534-201ENSMUST00000175365 125 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Gm25019-201ENSMUST00000179732 110 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Mir6344-201ENSMUST00000183462 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Gm37386-201ENSMUST00000194755 72 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Gm18150-201ENSMUST00000195341 645 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Gm44403-201ENSMUST00000198554 129 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Gm43309-201ENSMUST00000200837 458 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Gm6719-201ENSMUST00000202067 335 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Gm18791-201ENSMUST00000204611 726 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 1700025K04Rik-201ENSMUST00000218075 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 AC109180.1-201ENSMUST00000218676 398 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Vmn1r54-201ENSMUST00000058039 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Olfr813-201ENSMUST00000064893 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Xlr5c-201ENSMUST00000088450 540 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Nfyc-202ENSMUST00000097906 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 AC124579.1-201ENSMUST00000223468 2520 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Dpp10-202ENSMUST00000112606 15297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Macf1-204ENSMUST00000106213 18957 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Scn9a-207ENSMUST00000169900 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Olfr1389-202ENSMUST00000216641 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Pnpla8-204ENSMUST00000143771 2974 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Pgap1-201ENSMUST00000097739 10583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Olfr1271-202ENSMUST00000216383 6613 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Slc22a30-201ENSMUST00000064507 1888 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Med14-203ENSMUST00000115481 3729 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Mysm1-201ENSMUST00000075872 7420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Zfp808-204ENSMUST00000221772 1379 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Adgrg2-201ENSMUST00000112398 3418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Sema3a-201ENSMUST00000030714 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Olfr51-202ENSMUST00000213415 2819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Arpp19-203ENSMUST00000166549 1747 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Olfr965-203ENSMUST00000215164 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Gm22899-201ENSMUST00000104540 131 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Rps19-ps7-201ENSMUST00000116122 438 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Gm12231-201ENSMUST00000119447 695 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Vmn1r-ps102-201ENSMUST00000120663 886 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Gm3362-201ENSMUST00000148102 466 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Cldn5O54942 Gm22326-201ENSMUST00000158897 351 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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