Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Foxr2-201ENSMUST00000096265 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
MttpO08601 Scfd1-201ENSMUST00000021335 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
MttpO08601 Gm43831-201ENSMUST00000200461 2598 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
MttpO08601 Pgap1-201ENSMUST00000097739 10583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
MttpO08601 Gm28183-201ENSMUST00000191321 1406 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
MttpO08601 Gm43781-201ENSMUST00000197634 2681 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
MttpO08601 Olfr403-202ENSMUST00000206114 3444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
MttpO08601 Vmn1r13-202ENSMUST00000226892 5156 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
MttpO08601 Gm14033-201ENSMUST00000128307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
MttpO08601 Chrm3-201ENSMUST00000063093 1770 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
MttpO08601 Ighv1-36-201ENSMUST00000103513 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
MttpO08601 Trav2-201ENSMUST00000103568 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
MttpO08601 Lrrc69-202ENSMUST00000108276 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
MttpO08601 Olfr260-ps1-201ENSMUST00000117279 822 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm12317-201ENSMUST00000122307 319 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm15522-201ENSMUST00000134467 785 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
MttpO08601 AI662270-201ENSMUST00000142709 304 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm13411-201ENSMUST00000149429 414 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm3053-201ENSMUST00000161709 616 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gng2-206ENSMUST00000162425 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
MttpO08601 Vmn1r-ps25-201ENSMUST00000173545 799 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
MttpO08601 Mir3473c-201ENSMUST00000175262 81 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
MttpO08601 Vmn1r-ps148-201ENSMUST00000176775 455 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
MttpO08601 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
MttpO08601 Cox6b2-209ENSMUST00000184143 435 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm28769-201ENSMUST00000190176 615 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
MttpO08601 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
MttpO08601 C78283-201ENSMUST00000202711 848 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
MttpO08601 Rho-205ENSMUST00000203877 939 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm43919-201ENSMUST00000204303 364 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm32846-201ENSMUST00000205665 842 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm45690-201ENSMUST00000210775 246 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm45701-201ENSMUST00000212049 235 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm19936-201ENSMUST00000216414 838 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm40392-201ENSMUST00000220656 562 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
MttpO08601 AC154305.3-201ENSMUST00000224661 552 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
MttpO08601 Olfr1537-201ENSMUST00000073248 945 ntAPPRIS P2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
MttpO08601 Rpl26-201ENSMUST00000073471 526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
MttpO08601 Olfr229-201ENSMUST00000076802 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
MttpO08601 Olfr1446-201ENSMUST00000081236 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
MttpO08601 Xlr4b-203ENSMUST00000081827 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
MttpO08601 n-R5s170-201ENSMUST00000083726 113 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm23796-201ENSMUST00000084011 160 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
MttpO08601 Olfr810-201ENSMUST00000091986 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
MttpO08601 Vwa5a-201ENSMUST00000001544 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
MttpO08601 AC159326.1-201ENSMUST00000219989 1302 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
MttpO08601 Cd44-202ENSMUST00000060516 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
MttpO08601 Vmn1r34-204ENSMUST00000226999 3048 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
MttpO08601 Scml2-203ENSMUST00000077375 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
MttpO08601 Spag17-204ENSMUST00000164539 7862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
MttpO08601 Nr1h5-201ENSMUST00000058899 2835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
MttpO08601 Olfr1270-205ENSMUST00000216354 4836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 Olfr50-202ENSMUST00000216753 4531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 Vmn2r-ps120-201ENSMUST00000176341 2409 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 Olfr181-204ENSMUST00000205986 1891 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 Olfr945-202ENSMUST00000216698 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm43209-201ENSMUST00000198949 1588 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm45853-201ENSMUST00000212310 3171 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 Vmn1r39-203ENSMUST00000227285 2245 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm23879-201ENSMUST00000116874 126 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm15560-201ENSMUST00000117107 643 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm5383-201ENSMUST00000121177 617 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm15388-201ENSMUST00000121578 726 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 Mup-ps15-201ENSMUST00000121741 539 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 Rps10-ps3-201ENSMUST00000122317 500 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 Mageb6-ps-201ENSMUST00000126612 1032 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 9030622O22Rik-201ENSMUST00000129082 1245 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm16220-201ENSMUST00000131874 405 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm15687-201ENSMUST00000141440 269 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 5730412P04Rik-201ENSMUST00000147100 1149 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm16060-201ENSMUST00000153140 478 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm26153-201ENSMUST00000157433 127 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm22870-201ENSMUST00000157501 112 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 4430402I18Rik-203ENSMUST00000160542 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 Vdac2-208ENSMUST00000172727 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 Rpl9-ps5-201ENSMUST00000174221 571 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 Obox4-ps14-201ENSMUST00000177198 1127 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 Serpinb10-202ENSMUST00000182198 1265 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm27492-201ENSMUST00000185194 187 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 Mrgprb9-ps-201ENSMUST00000188739 892 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm28763-201ENSMUST00000188870 166 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm29579-201ENSMUST00000190820 166 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm19057-201ENSMUST00000194329 1197 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 Mirlet7e-201ENSMUST00000196737 93 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm2142-201ENSMUST00000197899 589 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm3148-201ENSMUST00000203594 612 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 Klra14-ps-202ENSMUST00000203601 1104 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm45171-201ENSMUST00000206360 736 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 AC127279.1-201ENSMUST00000220140 637 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 CT025616.1-201ENSMUST00000221158 412 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm2645-201ENSMUST00000223516 547 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 AC154184.2-201ENSMUST00000225335 349 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 AC154738.4-201ENSMUST00000228310 414 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 Serpinb9d-201ENSMUST00000067198 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm25260-201ENSMUST00000083053 134 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 Kncn-201ENSMUST00000097918 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 Stard9-207ENSMUST00000180041 15102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
MttpO08601 Gm37607-201ENSMUST00000194925 2623 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms