Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Gm18465-201ENSMUST00000207468 369 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Gm18464-201ENSMUST00000207803 420 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Gm18458-201ENSMUST00000207908 369 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Gm18461-201ENSMUST00000208421 420 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Kcnj1-203ENSMUST00000213393 1277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Olfr1245-201ENSMUST00000214870 1062 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Olfr247-202ENSMUST00000215871 1983 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 AC113059.3-201ENSMUST00000217423 2777 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Gm17915-201ENSMUST00000222077 548 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Elk3-205ENSMUST00000223340 750 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 AC160120.1-201ENSMUST00000227446 663 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Vmn1r34-206ENSMUST00000228498 3078 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Olfr934-201ENSMUST00000074211 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Mup14-202ENSMUST00000075206 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Olfr781-201ENSMUST00000075613 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Vmn1r183-201ENSMUST00000086012 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Olfr625-ps1-201ENSMUST00000098195 966 ntAPPRIS P5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Gm6043-201ENSMUST00000099961 492 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Gm45137-201ENSMUST00000208652 4415 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Wdr17-209ENSMUST00000150488 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Gm42876-201ENSMUST00000196989 3215 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 AL589737.1-201ENSMUST00000221163 2763 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 AC152414.1-201ENSMUST00000218784 2287 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 4930510E17Rik-201ENSMUST00000034550 1639 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Gm21704-201ENSMUST00000169382 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Rbmy-202ENSMUST00000171534 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Gm21708-202ENSMUST00000188091 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Gm10256-203ENSMUST00000189964 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Olfr1341-203ENSMUST00000215117 4700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Macc1-205ENSMUST00000222784 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Svs2-202ENSMUST00000109374 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Emcn-201ENSMUST00000119475 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Fbxw23-202ENSMUST00000198480 1388 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Jchain-201ENSMUST00000087033 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Gm12051-201ENSMUST00000147771 1341 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Gm13023-202ENSMUST00000105770 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Gm3086-201ENSMUST00000110560 620 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Ctps2-203ENSMUST00000112300 741 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Gm13771-201ENSMUST00000117988 238 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Gm14876-201ENSMUST00000120795 327 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Gm14125-202ENSMUST00000120921 756 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Gm16096-202ENSMUST00000149386 819 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Il2ra-202ENSMUST00000150890 1013 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Gm26169-201ENSMUST00000158420 135 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 1700058P15Rik-201ENSMUST00000159981 413 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Obox3-ps8-201ENSMUST00000177182 960 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Gm6214-201ENSMUST00000178845 541 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Gm26863-201ENSMUST00000181144 624 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Trav6-5-202ENSMUST00000183488 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Mir6400-201ENSMUST00000184870 92 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Gm27492-201ENSMUST00000185194 187 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Nabp1-207ENSMUST00000188204 972 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Trav23-201ENSMUST00000199137 347 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Gm44776-201ENSMUST00000207212 381 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Olfr682-ps1-202ENSMUST00000214399 897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 AC123064.2-201ENSMUST00000217758 193 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 AC166358.3-201ENSMUST00000221456 181 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 AC125543.4-201ENSMUST00000223385 117 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 CT025579.3-201ENSMUST00000224543 451 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 AC192333.6-201ENSMUST00000224565 725 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Gtpbp8-201ENSMUST00000023348 836 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Rps4x-201ENSMUST00000033683 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Olfr137-201ENSMUST00000057394 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Vmn1r211-201ENSMUST00000073728 985 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Olfr135-201ENSMUST00000076245 1079 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Olfr1271-201ENSMUST00000099751 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Rbm41-203ENSMUST00000113007 3691 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Gm2396-202ENSMUST00000188232 3433 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Cdh10-201ENSMUST00000040562 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Vmn1r30-204ENSMUST00000228577 1968 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Syne2-201ENSMUST00000044217 21690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 5730408A14Rik-201ENSMUST00000194955 1824 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Vmn2r-ps5-201ENSMUST00000175971 2730 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Gm45211-201ENSMUST00000206208 2650 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Gm4631-202ENSMUST00000121393 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Gm37527-201ENSMUST00000192406 3547 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 1700017N19Rik-204ENSMUST00000188736 1709 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Vmn2r-ps128-201ENSMUST00000176367 2570 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Fgd4-206ENSMUST00000161861 8342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Gm37363-201ENSMUST00000192336 2233 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Fap-201ENSMUST00000000402 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 C87499-203ENSMUST00000107143 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Psg20-201ENSMUST00000076677 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Olfr728-202ENSMUST00000213685 7087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Gm42717-201ENSMUST00000197309 3463 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Gm13310-201ENSMUST00000120962 1381 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Gm43341-201ENSMUST00000200104 1308 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Ktn1-201ENSMUST00000022391 4484 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Mir683-2-201ENSMUST00000102099 109 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Gm23709-201ENSMUST00000104364 130 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Gm9733-201ENSMUST00000108361 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Gm14393-202ENSMUST00000109066 564 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Gm20795J3QP49 Gm15923-201ENSMUST00000119300 1169 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms