Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5511-201ENSMUST00000189380 802 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37881-201ENSMUST00000193001 421 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37095-201ENSMUST00000195421 205 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43712-201ENSMUST00000198020 291 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 2400006E01Rik-203ENSMUST00000199633 643 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42458-201ENSMUST00000201914 369 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44221-201ENSMUST00000203552 388 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18007-201ENSMUST00000205019 844 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC123658.1-201ENSMUST00000228364 867 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr720-201ENSMUST00000035250 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1325-201ENSMUST00000054541 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elavl4-205ENSMUST00000106600 3799 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddx3y-201ENSMUST00000091190 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38125-201ENSMUST00000194136 3438 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42729-201ENSMUST00000201770 2930 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38264-201ENSMUST00000194850 2032 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 5330437M03Rik-201ENSMUST00000201318 4083 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mlip-205ENSMUST00000183955 3069 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC112142.1-203ENSMUST00000228670 2472 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Btbd35f7-201ENSMUST00000105007 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Btbd35f19-201ENSMUST00000178444 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Btbd35f20-201ENSMUST00000179325 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42704-201ENSMUST00000196875 1778 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2987-201ENSMUST00000187673 1693 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 6720489N17Rik-202ENSMUST00000201563 2640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp426-201ENSMUST00000080386 2417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930503E14Rik-201ENSMUST00000100688 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12760-201ENSMUST00000117861 482 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12571-201ENSMUST00000118132 243 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16365-204ENSMUST00000143877 779 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23327-201ENSMUST00000157420 78 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16114-201ENSMUST00000161930 300 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Speer4cos-201ENSMUST00000162113 1083 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4675-201ENSMUST00000163396 502 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5139-201ENSMUST00000175943 249 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700015G11Rik-204ENSMUST00000190307 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1228-201ENSMUST00000190757 1094 ntAPPRIS P2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17953-201ENSMUST00000192061 667 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37070-201ENSMUST00000193272 460 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ighv1-27-201ENSMUST00000194473 340 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43391-201ENSMUST00000196145 883 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21847-202ENSMUST00000198681 883 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43945-201ENSMUST00000203595 754 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44879-201ENSMUST00000207007 503 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC123064.2-201ENSMUST00000217758 193 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aoah-202ENSMUST00000221982 919 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ssxb1-201ENSMUST00000037297 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr135-201ENSMUST00000076245 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16415-201ENSMUST00000080097 489 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10916-201ENSMUST00000080330 483 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2099-202ENSMUST00000223310 3341 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Neb-202ENSMUST00000036934 22489 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Brcc3-202ENSMUST00000114074 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r43-201ENSMUST00000066317 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fap-201ENSMUST00000000402 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r174-202ENSMUST00000228331 9058 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44109-201ENSMUST00000204514 1954 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp3a57-201ENSMUST00000079268 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp934-203ENSMUST00000220648 2439 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr123-202ENSMUST00000214770 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slco6d1-201ENSMUST00000027575 2328 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm41-202ENSMUST00000087400 2229 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr270-204ENSMUST00000215127 3145 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r171-206ENSMUST00000227386 2570 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r171-208ENSMUST00000227866 2566 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21704-201ENSMUST00000169382 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbmy-202ENSMUST00000171534 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21708-202ENSMUST00000188091 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10256-203ENSMUST00000189964 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37397-201ENSMUST00000194579 2842 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr884-202ENSMUST00000181088 3185 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ncr1-202ENSMUST00000126417 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbl1xr1-202ENSMUST00000192328 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC108802.1-201ENSMUST00000219501 3142 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igkv1-88-201ENSMUST00000103336 362 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trav6n-6-201ENSMUST00000103613 287 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13815-201ENSMUST00000119963 412 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crem-219ENSMUST00000140332 1015 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24774-201ENSMUST00000157384 134 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700116B05Rik-201ENSMUST00000173461 414 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20428-201ENSMUST00000174365 283 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4617-201ENSMUST00000178993 331 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 C130060C02Rik-201ENSMUST00000181731 1142 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27543-201ENSMUST00000183562 177 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28097-201ENSMUST00000187333 366 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37636-201ENSMUST00000193583 359 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC133189.1-201ENSMUST00000198820 140 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5886-201ENSMUST00000203420 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm32916-203ENSMUST00000208033 789 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45157-201ENSMUST00000208729 401 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC159231.1-201ENSMUST00000225365 226 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154618.1-201ENSMUST00000227451 303 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r178-201ENSMUST00000078593 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.9 ms