Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm43524-201ENSMUST00000197278 298 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm42990-201ENSMUST00000199231 312 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm43418-201ENSMUST00000201334 428 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm32846-201ENSMUST00000205665 842 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 B130024G19Rik-205ENSMUST00000207952 485 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Olfr494-201ENSMUST00000209743 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Olfr494-202ENSMUST00000210291 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm18645-202ENSMUST00000212222 760 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 AC127279.1-201ENSMUST00000220140 637 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 CT025616.1-201ENSMUST00000221158 412 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 AC140209.1-204ENSMUST00000226736 739 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 AC121912.1-201ENSMUST00000227525 1201 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 AC125539.2-202ENSMUST00000227983 587 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 AC125539.2-201ENSMUST00000228339 753 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Olfr682-ps1-201ENSMUST00000071242 934 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Olfr971-201ENSMUST00000075467 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Tas2r140-201ENSMUST00000095391 1000 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Zfp799-201ENSMUST00000179695 5833 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Nexn-212ENSMUST00000199470 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Btbd35f15-201ENSMUST00000186329 1917 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Fbxl17-204ENSMUST00000112840 3667 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Olfr1238-203ENSMUST00000217237 5761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Postn-202ENSMUST00000081564 2670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Cbx5-202ENSMUST00000118152 8803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Olfr133-203ENSMUST00000215078 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Ankar-203ENSMUST00000212573 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Cnot1-202ENSMUST00000098473 8390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Casp8ap2-202ENSMUST00000108178 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm11313-201ENSMUST00000118779 432 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm15357-201ENSMUST00000119160 285 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm11366-201ENSMUST00000119279 429 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm15828-201ENSMUST00000119911 522 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Rps10-ps3-201ENSMUST00000122317 500 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm12127-201ENSMUST00000123278 706 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 4930547E08Rik-201ENSMUST00000143559 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm22804-201ENSMUST00000158052 101 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Vmn1r160-201ENSMUST00000171745 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm27688-201ENSMUST00000183634 91 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm28385-201ENSMUST00000185671 292 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm28962-201ENSMUST00000187993 621 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm29148-201ENSMUST00000188140 336 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 1700084F23Rik-205ENSMUST00000191362 743 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm32391-201ENSMUST00000191839 540 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Ighv3-4-201ENSMUST00000193408 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 AC157515.1-201ENSMUST00000220953 450 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 AC125543.1-201ENSMUST00000222778 101 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 CT025525.1-201ENSMUST00000226325 1054 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 AC098742.1-201ENSMUST00000227945 373 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Xlr4b-203ENSMUST00000081827 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Vmn1r185-203ENSMUST00000227264 5589 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm7697-201ENSMUST00000201500 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Olfr365-202ENSMUST00000213969 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm6162-201ENSMUST00000194870 2930 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Elavl2-202ENSMUST00000102799 3840 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Acsm3-204ENSMUST00000106528 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gabra6-201ENSMUST00000020703 2436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Olfr1537-202ENSMUST00000213472 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Malrd1-201ENSMUST00000146205 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm43781-201ENSMUST00000197634 2681 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Ms4a7-201ENSMUST00000025574 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Chrm3-201ENSMUST00000063093 1770 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Pramef6-202ENSMUST00000105767 1967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Olfr372-202ENSMUST00000215324 3542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Serpinb3b-202ENSMUST00000166100 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Olfr518-202ENSMUST00000217803 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Olfr50-202ENSMUST00000216753 4531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Zfp266-202ENSMUST00000174462 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Vmn1r171-211ENSMUST00000228559 2637 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm16440-201ENSMUST00000100900 1089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Trav16d-dv11-201ENSMUST00000103606 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm16128-201ENSMUST00000117855 626 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm12757-201ENSMUST00000119465 800 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm12317-201ENSMUST00000122307 319 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm12854-201ENSMUST00000128518 297 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm12602-202ENSMUST00000154352 707 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm3531-201ENSMUST00000162698 489 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm6673-201ENSMUST00000166114 700 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm7876-201ENSMUST00000169465 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm3043-201ENSMUST00000170639 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Obox4-ps14-201ENSMUST00000177198 1127 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm25019-201ENSMUST00000179732 110 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Rian-217ENSMUST00000183266 687 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm5511-201ENSMUST00000189380 802 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm37473-201ENSMUST00000195079 674 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm6057-201ENSMUST00000195927 314 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Obox4-ps32-201ENSMUST00000196512 537 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm42593-201ENSMUST00000198469 377 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm43344-201ENSMUST00000198723 1229 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm2607-201ENSMUST00000212389 627 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms