Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Gm18667-201ENSMUST00000186523 484 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Olfr1252-201ENSMUST00000186710 1099 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm28883-201ENSMUST00000189256 369 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 4930532M18Rik-202ENSMUST00000190980 534 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm7967-203ENSMUST00000191409 1049 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm38395-201ENSMUST00000199904 830 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Ighv1-79-201ENSMUST00000200152 350 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm15754-202ENSMUST00000202846 758 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm32591-202ENSMUST00000204063 403 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm45722-201ENSMUST00000213075 466 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 AC140381.1-201ENSMUST00000219168 367 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Pah-204ENSMUST00000219813 789 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 AC119894.1-201ENSMUST00000220399 350 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 AC141642.1-201ENSMUST00000220598 229 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 AC113198.1-201ENSMUST00000226353 832 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm5229-201ENSMUST00000039375 354 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Fam229b-201ENSMUST00000063204 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Olfr970-201ENSMUST00000071132 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Olfr1431-201ENSMUST00000072316 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Olfr969-201ENSMUST00000074566 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Kcnma1-208ENSMUST00000177634 4605 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Tmem167-201ENSMUST00000012566 1541 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Dctn4-201ENSMUST00000025505 3738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Rabgap1-203ENSMUST00000112920 4847 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm7980-201ENSMUST00000168107 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm14857-201ENSMUST00000117862 3185 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 BC018473-204ENSMUST00000156293 4753 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Olfr39-202ENSMUST00000212983 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Rsrc2-219ENSMUST00000182955 1685 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm5415-201ENSMUST00000171322 3609 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Rgs17-204ENSMUST00000131996 8107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Ugt2b1-201ENSMUST00000031183 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm11406-201ENSMUST00000117418 484 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm11212-201ENSMUST00000118337 618 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm14906-201ENSMUST00000119265 390 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm15331-201ENSMUST00000120225 385 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gng2-ps1-201ENSMUST00000120523 217 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm13720-201ENSMUST00000120741 196 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm15801-201ENSMUST00000120920 522 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Olfr1021-ps1-201ENSMUST00000121914 1042 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm12317-201ENSMUST00000122307 319 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 4930555B12Rik-201ENSMUST00000135444 283 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 1700016G14Rik-201ENSMUST00000136906 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm24741-201ENSMUST00000158857 106 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm8783-201ENSMUST00000159764 522 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 1700016C15Rik-201ENSMUST00000016106 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm14819-202ENSMUST00000169396 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm22932-201ENSMUST00000175510 72 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Obox4-ps23-201ENSMUST00000175738 1137 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm20663-201ENSMUST00000176647 474 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm10487-201ENSMUST00000177566 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm14632-202ENSMUST00000177917 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm10058-202ENSMUST00000178152 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm21244-201ENSMUST00000178447 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm10096-201ENSMUST00000178672 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm10230-202ENSMUST00000178745 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm2092-201ENSMUST00000178887 639 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm10147-202ENSMUST00000178966 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Obox4-ps22-201ENSMUST00000179602 1137 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm2759-201ENSMUST00000179938 639 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Obox4-ps13-201ENSMUST00000180123 1137 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm6055-201ENSMUST00000180532 378 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Mir7220-201ENSMUST00000183978 60 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Olfr1215-201ENSMUST00000188399 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm29598-201ENSMUST00000188996 588 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm37727-201ENSMUST00000191637 819 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm3143-201ENSMUST00000196308 580 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm42437-201ENSMUST00000197263 923 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Trav3-2-201ENSMUST00000198999 305 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm39119-201ENSMUST00000208466 951 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm9237-201ENSMUST00000221499 548 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm4012-201ENSMUST00000221504 581 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 AC153794.2-201ENSMUST00000222650 550 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 AC163721.1-201ENSMUST00000222669 394 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 CT025598.1-201ENSMUST00000225140 427 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Creg1-201ENSMUST00000040298 425 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Olfr693-201ENSMUST00000057817 952 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Olfr849-201ENSMUST00000063923 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm5582-201ENSMUST00000075251 522 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Olfr657-201ENSMUST00000098171 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Olfr1024-201ENSMUST00000099912 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms