Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Olfr1034-201ENSMUST00000213496 4882 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm38029-201ENSMUST00000192669 2090 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Mid2-203ENSMUST00000112993 5916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Clk1-201ENSMUST00000034868 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm37686-201ENSMUST00000194099 2309 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Slco6d1-201ENSMUST00000027575 2328 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Rbm41-204ENSMUST00000113011 3728 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r173-202ENSMUST00000226233 9416 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm42661-201ENSMUST00000202364 1442 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm42561-201ENSMUST00000202563 1442 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm42494-201ENSMUST00000196515 3051 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Rgsl1-201ENSMUST00000124558 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm29536-201ENSMUST00000189296 3283 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Olfr47-202ENSMUST00000215569 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Zfp873-201ENSMUST00000105313 1893 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Akr1c14-202ENSMUST00000118717 3183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Cmah-202ENSMUST00000110391 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r39-207ENSMUST00000228862 2398 ntAPPRIS P2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm23193-201ENSMUST00000102427 82 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Ifit2-201ENSMUST00000102826 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm23910-201ENSMUST00000104597 132 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Hspb11-202ENSMUST00000106749 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Olfr1146-ps1-201ENSMUST00000117180 943 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm2288-201ENSMUST00000118560 638 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm11409-201ENSMUST00000118621 403 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Olfr1035-ps1-201ENSMUST00000120109 966 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm15019-201ENSMUST00000120148 434 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm14229-201ENSMUST00000121178 850 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm11965-201ENSMUST00000122017 277 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm15178-201ENSMUST00000132100 472 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm13180-201ENSMUST00000141222 440 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm22601-201ENSMUST00000157595 250 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm25430-201ENSMUST00000157614 289 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm3025-201ENSMUST00000163454 489 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm3077-201ENSMUST00000165903 627 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm2878-201ENSMUST00000170173 486 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Rps8-ps1-201ENSMUST00000172445 624 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r-ps48-201ENSMUST00000176352 886 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 1700101I11Rik-201ENSMUST00000181594 896 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm26993-201ENSMUST00000182766 789 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm29513-201ENSMUST00000185741 202 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm43304-201ENSMUST00000196803 326 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm9480-201ENSMUST00000198038 616 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm19060-201ENSMUST00000201959 421 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm7838-201ENSMUST00000203221 1189 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm44079-201ENSMUST00000204889 529 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm44919-201ENSMUST00000208587 1073 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm44845-201ENSMUST00000208773 335 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 AC160635.2-201ENSMUST00000216368 734 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 AC155808.1-201ENSMUST00000219288 409 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 AC163621.2-201ENSMUST00000222229 682 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 AC127371.1-201ENSMUST00000228516 312 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Mrgprb8-201ENSMUST00000056676 1123 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Olfr8-201ENSMUST00000081571 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Mir199a-2-201ENSMUST00000093618 110 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Olfr806-201ENSMUST00000095245 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Clca4c-ps-201ENSMUST00000098551 712 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Serpini1-201ENSMUST00000029423 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 R3hdm1-201ENSMUST00000036288 4795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Tsga10-203ENSMUST00000114902 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Wac-217ENSMUST00000172018 1965 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm44109-201ENSMUST00000204514 1954 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gpr21-201ENSMUST00000065441 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Olfr1000-202ENSMUST00000213837 1915 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 AC159476.1-201ENSMUST00000215914 1668 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Ankrd28-204ENSMUST00000227089 3522 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Agbl1-201ENSMUST00000026854 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Olfr963-202ENSMUST00000215649 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Zfp950-207ENSMUST00000180544 2568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm45066-201ENSMUST00000207528 2551 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Clvs1-201ENSMUST00000038841 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm9611-201ENSMUST00000100698 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm24230-201ENSMUST00000104313 129 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Rps15a-201ENSMUST00000106588 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Glrb-202ENSMUST00000107743 1101 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm14861-201ENSMUST00000119451 455 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Olfr1050-ps1-201ENSMUST00000119802 947 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm15791-201ENSMUST00000120365 319 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm12317-201ENSMUST00000122307 319 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Ftx-201ENSMUST00000123841 673 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 C030037D09Rik-201ENSMUST00000125967 367 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 1700007M16Rik-201ENSMUST00000129075 435 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Tbata-207ENSMUST00000140456 953 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm14216-202ENSMUST00000155334 492 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm6808-201ENSMUST00000162341 807 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm3633-202ENSMUST00000163102 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Bhlhe40-202ENSMUST00000163617 476 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm17727-201ENSMUST00000171898 643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm24957-201ENSMUST00000179604 132 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm19200-201ENSMUST00000182579 1001 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 AC136146.1-201ENSMUST00000196180 91 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Pvrig-ps-201ENSMUST00000199472 204 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Klrb1b-204ENSMUST00000205130 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm44523-201ENSMUST00000205616 417 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms