Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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Rpl39lQ9CQD0 Gm29557-201ENSMUST00000188245 370 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Gm28174-201ENSMUST00000191003 370 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rpl39lQ9CQD0 Igkv3-8-201ENSMUST00000197635 339 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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Rpl39lQ9CQD0 Slc22a30-201ENSMUST00000064507 1888 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rpl39lQ9CQD0 Fam205c-202ENSMUST00000107978 1451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
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Rpl39lQ9CQD0 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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Rpl39lQ9CQD0 Sdr16c6-201ENSMUST00000095151 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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Rpl39lQ9CQD0 Stk31-204ENSMUST00000172459 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rpl39lQ9CQD0 Gm830-201ENSMUST00000142458 3502 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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Rpl39lQ9CQD0 Nat2-201ENSMUST00000093470 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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Rpl39lQ9CQD0 Il1a-201ENSMUST00000028882 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rpl39lQ9CQD0 Gm42455-201ENSMUST00000199761 2736 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rpl39lQ9CQD0 Olfr1471-205ENSMUST00000217482 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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