Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Olfr1111-202ENSMUST00000214492 1616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Cops2-202ENSMUST00000110462 1853 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Cxcr6-201ENSMUST00000049810 1897 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Olfr738-202ENSMUST00000214320 2114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Gm42873-201ENSMUST00000196110 1726 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Olfr449-202ENSMUST00000204072 1974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Abi1-212ENSMUST00000153931 2729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Rapgef6-204ENSMUST00000108894 3475 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Vmn2r-ps115-201ENSMUST00000177393 1809 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 AC124586.1-201ENSMUST00000221673 2795 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Fbxw18-201ENSMUST00000098359 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Mir680-1-201ENSMUST00000102257 109 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Gm14772-201ENSMUST00000116562 514 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Gm13009-201ENSMUST00000121307 267 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Gm15696-201ENSMUST00000121730 445 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Gm27579-201ENSMUST00000158113 63 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Gm15812-201ENSMUST00000162331 748 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Gm3531-201ENSMUST00000162698 489 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Gm9286-201ENSMUST00000173586 508 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Gm23139-201ENSMUST00000179454 132 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Gm8357-201ENSMUST00000181115 1011 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Mir8094-201ENSMUST00000183361 117 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Mir7084-201ENSMUST00000183876 70 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Gm28604-201ENSMUST00000186629 484 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Gm28566-201ENSMUST00000186714 484 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Gm28194-201ENSMUST00000187412 484 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Gm28886-202ENSMUST00000187889 484 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Gm28554-202ENSMUST00000189175 484 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Gm29213-202ENSMUST00000189703 484 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Gm28851-202ENSMUST00000189757 484 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Gm28461-201ENSMUST00000190023 484 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Gm29332-201ENSMUST00000190829 227 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 4931440P22Rik-205ENSMUST00000194448 474 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Ighv1-17-1-201ENSMUST00000194849 351 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Gm36241-201ENSMUST00000201085 493 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Gm43941-201ENSMUST00000203303 1073 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 AC159380.1-201ENSMUST00000218096 121 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 AC192091.1-201ENSMUST00000218668 439 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 AC144942.1-201ENSMUST00000220425 597 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 CT025616.1-201ENSMUST00000221158 412 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 AC108947.1-201ENSMUST00000224274 1000 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 AC165092.4-201ENSMUST00000225025 679 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 AC126275.2-201ENSMUST00000225224 253 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 CT010453.2-201ENSMUST00000227005 483 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Uqcrh-201ENSMUST00000050580 402 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Cldn34c4-201ENSMUST00000052500 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Stfa3-201ENSMUST00000068182 412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Gm5160-201ENSMUST00000069552 444 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Gm26225-201ENSMUST00000082508 135 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Gm22508-201ENSMUST00000082772 110 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Rny1-201ENSMUST00000083767 112 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Olfr1427-201ENSMUST00000087825 938 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Sprr2a3-201ENSMUST00000090872 682 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Ang6-201ENSMUST00000096869 444 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Cast-207ENSMUST00000222588 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Gm45601-201ENSMUST00000211483 6753 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Gm44679-201ENSMUST00000207202 2908 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Olfr342-202ENSMUST00000216275 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Mylk4-201ENSMUST00000057428 5571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Cep120-201ENSMUST00000049811 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 A730011C13Rik-202ENSMUST00000141787 1877 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Gm8765-201ENSMUST00000099518 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Gm906-201ENSMUST00000099521 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Homez-201ENSMUST00000081162 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Gm22781-201ENSMUST00000104083 137 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Znf48Q3US17 Gm14517-201ENSMUST00000119040 337 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms