Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Vmn1r171-201ENSMUST00000078458 1581 ntAPPRIS P2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Gm11550-201ENSMUST00000118210 699 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Gm12880-201ENSMUST00000120652 494 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 n-R5s24-201ENSMUST00000122518 117 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 3110004A20Rik-201ENSMUST00000123904 385 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Gm11583-201ENSMUST00000132296 466 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Gm25389-201ENSMUST00000157340 286 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Gm23046-201ENSMUST00000158369 284 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Gm6872-201ENSMUST00000165001 700 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Gm17086-201ENSMUST00000171346 484 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Obox4-ps14-201ENSMUST00000177198 1127 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Gm26731-201ENSMUST00000180683 543 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Scgb1b6-ps-201ENSMUST00000185337 199 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Gm17775-201ENSMUST00000198542 258 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Gm43794-201ENSMUST00000200971 692 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Olfr442-ps1-201ENSMUST00000204261 316 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Gm44050-201ENSMUST00000204263 527 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Gm6828-201ENSMUST00000207902 1186 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Gm17820-201ENSMUST00000220213 1068 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Gm4263-202ENSMUST00000221392 667 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Pik3c2g-201ENSMUST00000032353 1206 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Olfr1442-201ENSMUST00000057924 1065 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Rpl21-ps6-201ENSMUST00000074828 468 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Gm10115-201ENSMUST00000076071 1228 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 n-R5s13-201ENSMUST00000093707 119 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Olfr1221-201ENSMUST00000099795 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Rad21l-201ENSMUST00000096439 1650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Gm43313-201ENSMUST00000201398 2235 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 AC122357.2-201ENSMUST00000220732 1525 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Olfr1305-203ENSMUST00000213737 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Vmn2r-ps130-201ENSMUST00000175853 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Vmn2r-ps129-201ENSMUST00000177509 2568 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Gm28074-201ENSMUST00000190424 1497 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Clmn-201ENSMUST00000109936 11866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Sh3kbp1-202ENSMUST00000080394 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Fap-201ENSMUST00000000402 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Gm24350-201ENSMUST00000104163 133 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Gm13103-202ENSMUST00000105768 994 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Gm15001-201ENSMUST00000117657 795 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Gm15385-201ENSMUST00000118725 667 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 4933416I08Rik-201ENSMUST00000125315 703 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Gm23022-201ENSMUST00000158768 180 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Gm17154-201ENSMUST00000165748 431 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 9130204L05Rik-201ENSMUST00000166173 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Rpl23a-ps12-201ENSMUST00000179178 468 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Gm26970-201ENSMUST00000182990 964 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Gm27234-201ENSMUST00000183362 581 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 1700010H22Rik-202ENSMUST00000187592 1003 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Gm18117-201ENSMUST00000187720 742 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Gm37982-201ENSMUST00000193076 561 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Gm37070-201ENSMUST00000193272 460 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Gm43198-201ENSMUST00000200927 326 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Gm30717-201ENSMUST00000206549 494 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Gm44893-201ENSMUST00000207259 443 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Slfn5os-202ENSMUST00000216469 550 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 AC130823.2-201ENSMUST00000226169 290 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Olfr873-201ENSMUST00000053919 1062 ntAPPRIS P2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Olfr1454-201ENSMUST00000073732 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Olfr784-201ENSMUST00000082342 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Stxbp3-ps-201ENSMUST00000090527 758 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Gm10540-201ENSMUST00000097581 276 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Cd180-204ENSMUST00000171267 1787 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Arhgap12-202ENSMUST00000077128 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Slc9a9-201ENSMUST00000033463 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Gm37760-201ENSMUST00000194726 3841 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Gm45183-201ENSMUST00000207937 1497 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Gm44424-201ENSMUST00000203438 1826 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Hbp1-206ENSMUST00000176103 1319 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Gm38090-201ENSMUST00000195733 1942 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Gm20125-201ENSMUST00000185722 3201 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Gm38372-201ENSMUST00000194854 4028 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Gramd1c-203ENSMUST00000179565 3159 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Tmco2-201ENSMUST00000106268 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Gm12598-201ENSMUST00000117333 830 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Gm15785-201ENSMUST00000119145 694 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Gm13720-201ENSMUST00000120741 196 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Gm26393-201ENSMUST00000157625 129 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Vmn1r122-201ENSMUST00000164409 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Vmn1r159-201ENSMUST00000167871 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Gm18604-201ENSMUST00000172535 558 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Trav7-3-201ENSMUST00000177622 402 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Mrgprb9-ps-201ENSMUST00000188739 892 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Gm29184-201ENSMUST00000190038 334 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Mir409-201ENSMUST00000198153 79 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 1110060G06Rik-201ENSMUST00000200372 499 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Olfr588-ps1-202ENSMUST00000210115 912 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Puf60Q3UEB3 Gm45690-201ENSMUST00000210775 246 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms