Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Gm3531-201ENSMUST00000162698 489 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Il18-202ENSMUST00000180021 702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Gm27355-201ENSMUST00000185045 128 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Gm4557-201ENSMUST00000185826 907 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Gm4526-201ENSMUST00000186039 920 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Gm29484-201ENSMUST00000186067 324 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Gm8708-201ENSMUST00000188500 906 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Gm3145-201ENSMUST00000188584 220 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Gm43724-201ENSMUST00000197516 226 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Gm43464-201ENSMUST00000198003 317 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Gm43018-201ENSMUST00000198075 1275 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Gm43698-202ENSMUST00000202864 555 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 AC164116.1-201ENSMUST00000225810 622 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Apcs-201ENSMUST00000027824 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Il18-201ENSMUST00000059081 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Snora52-201ENSMUST00000082732 137 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Mir342-201ENSMUST00000083502 99 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Gm43888-201ENSMUST00000204405 2587 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Elavl4-204ENSMUST00000106598 3997 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Gm38505-201ENSMUST00000174005 1326 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Slc22a30-201ENSMUST00000064507 1888 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Olfr516-202ENSMUST00000216092 1493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Olfr612-203ENSMUST00000215663 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Gm43188-201ENSMUST00000200180 2160 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r-ps11-201ENSMUST00000176568 2730 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Gm9921-201ENSMUST00000173293 4399 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Sycp2-201ENSMUST00000081134 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Traj2-201ENSMUST00000103738 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Gm11970-201ENSMUST00000116105 320 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Rps11-ps3-201ENSMUST00000117608 486 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Gm15670-201ENSMUST00000117740 447 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Gm14909-201ENSMUST00000117853 351 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Rpl23a-ps14-201ENSMUST00000118777 424 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Mrpl24-203ENSMUST00000121048 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 4933416I08Rik-201ENSMUST00000125315 703 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Gm12259-201ENSMUST00000138391 328 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Gm22870-201ENSMUST00000157501 112 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Gm17043-201ENSMUST00000164621 1283 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r-ps21-201ENSMUST00000176891 925 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Gm20711-201ENSMUST00000177351 714 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Gm27762-201ENSMUST00000183417 109 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Gm27201-201ENSMUST00000183818 416 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Gm22897-202ENSMUST00000197782 127 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Gm44330-201ENSMUST00000200106 143 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Minpp1-ps-201ENSMUST00000203344 946 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Gm45171-201ENSMUST00000206360 736 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Sult2a7-203ENSMUST00000210034 870 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Rps26-ps1-202ENSMUST00000212102 351 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Gm18997-201ENSMUST00000216353 822 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Olfr1152-201ENSMUST00000051058 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Olfr974-201ENSMUST00000062833 1080 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Olfr968-201ENSMUST00000075928 1027 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Olfr1168-201ENSMUST00000079599 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Magea3-201ENSMUST00000079867 963 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Olfr192-201ENSMUST00000080251 925 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Olfr206-201ENSMUST00000084791 1005 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Olfr806-201ENSMUST00000095245 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Olfr310-202ENSMUST00000217724 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Gm21704-201ENSMUST00000169382 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Rbmy-202ENSMUST00000171534 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Gm21708-202ENSMUST00000188091 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Gm10256-203ENSMUST00000189964 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Ttc33-202ENSMUST00000081640 1583 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Olfr584-202ENSMUST00000214215 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Klhl28-203ENSMUST00000222508 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Mmp16-201ENSMUST00000029881 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Fus-202ENSMUST00000079045 2623 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Olfr556-202ENSMUST00000213485 3825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Olfr107-204ENSMUST00000215974 2282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Gpr141-201ENSMUST00000065335 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Gm38259-201ENSMUST00000194602 3534 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Prl2b1-202ENSMUST00000102954 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Itpa-ps3-201ENSMUST00000119034 395 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Olfr1274-ps-201ENSMUST00000120681 1035 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Ccdc34os-201ENSMUST00000123633 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Gm13174-201ENSMUST00000126141 220 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Gm20428-201ENSMUST00000174365 283 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Gm16434-202ENSMUST00000177712 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Gm3453-202ENSMUST00000178308 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Gm6676-202ENSMUST00000178376 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Gm3127-203ENSMUST00000178386 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Gm3187-201ENSMUST00000178429 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Gm3685-202ENSMUST00000179199 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Mir3473g-201ENSMUST00000183494 136 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Gm37359-201ENSMUST00000195243 526 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Gm43919-201ENSMUST00000204303 364 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Fxyd1-210ENSMUST00000206012 501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Ankrd42-207ENSMUST00000207131 1220 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Gm44515-201ENSMUST00000209045 379 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Gm45702-201ENSMUST00000211856 644 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Olfr228-201ENSMUST00000216534 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 AC121804.2-201ENSMUST00000222531 316 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 AC112142.1-206ENSMUST00000228136 982 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Olfr135-201ENSMUST00000076245 1079 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 n-R5s27-201ENSMUST00000093699 119 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Olfr1277-201ENSMUST00000099619 962 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r169-204ENSMUST00000227932 2745 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms