Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm4321-201ENSMUST00000200520 442 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Tprkb-208ENSMUST00000200680 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm44307-201ENSMUST00000204466 764 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Olfr915-201ENSMUST00000215191 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm35326-201ENSMUST00000218234 1041 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 AC134439.1-201ENSMUST00000220923 600 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 AC192334.1-201ENSMUST00000221832 1268 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 AC125543.1-201ENSMUST00000222778 101 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 AC154692.1-201ENSMUST00000228314 544 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Olfr273-201ENSMUST00000051520 1059 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Olfr1467-201ENSMUST00000054687 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Glipr1l1-201ENSMUST00000073617 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Stard9-207ENSMUST00000180041 15102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Vmn1r204-202ENSMUST00000228195 2936 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Acer3-201ENSMUST00000033020 11340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Vmn2r99-201ENSMUST00000176107 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm5925-201ENSMUST00000105016 1497 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 1700017N19Rik-206ENSMUST00000190386 1483 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Trim38-201ENSMUST00000074067 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm37181-201ENSMUST00000192513 1727 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm12289-201ENSMUST00000130860 2235 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm6503-201ENSMUST00000210829 2225 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Ctsj-202ENSMUST00000224224 1421 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Nptn-205ENSMUST00000176250 4531 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm18163-201ENSMUST00000197877 1643 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm42681-201ENSMUST00000197999 1611 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 4932438A13Rik-217ENSMUST00000152564 15541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm9733-201ENSMUST00000108361 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm13452-201ENSMUST00000120896 1097 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Frmpd1os-201ENSMUST00000134640 415 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm14223-201ENSMUST00000146060 517 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Skint1-204ENSMUST00000162158 1260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm3091-201ENSMUST00000163408 484 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Rian-217ENSMUST00000183266 687 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm27636-201ENSMUST00000184528 122 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 1700027A15Rik-202ENSMUST00000188349 617 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Scgb2b9-ps-201ENSMUST00000189522 334 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm37934-201ENSMUST00000192902 402 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Obox4-ps5-201ENSMUST00000196368 397 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Obox4-ps4-201ENSMUST00000196934 397 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Obox4-ps10-201ENSMUST00000199376 504 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps5-201ENSMUST00000202963 931 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm35216-201ENSMUST00000203777 433 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm44665-201ENSMUST00000205381 251 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm45096-201ENSMUST00000205833 427 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Abca15-204ENSMUST00000207220 567 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm6850-201ENSMUST00000210031 530 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm18039-201ENSMUST00000217816 728 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 AC154472.2-201ENSMUST00000221186 288 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 1700011B04Rik-211ENSMUST00000222690 394 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Olfr493-201ENSMUST00000080106 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Olfr1265-202ENSMUST00000214855 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Slco1c1-203ENSMUST00000203140 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 8430419K02Rik-201ENSMUST00000128654 1870 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Inpp4b-203ENSMUST00000109852 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm42697-201ENSMUST00000198992 4092 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Clk4-203ENSMUST00000109113 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Dctn4-201ENSMUST00000025505 3738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Olfr1056-202ENSMUST00000216547 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Vmn1r185-205ENSMUST00000227461 5318 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Dmxl2-202ENSMUST00000118600 9465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Slc6a15-201ENSMUST00000074204 3607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Vmn2r24-201ENSMUST00000075095 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Btbd35f21-201ENSMUST00000105017 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Btbd35f27-201ENSMUST00000178143 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Btbd35f2-201ENSMUST00000179991 1949 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Btbd35f16-201ENSMUST00000185755 1949 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm5590-202ENSMUST00000186976 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Kcnu1-201ENSMUST00000098858 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm10933-201ENSMUST00000221891 1861 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Olfr516-202ENSMUST00000216092 1493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Igkv10-94-201ENSMUST00000103330 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm23948-201ENSMUST00000104030 132 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm22778-201ENSMUST00000104090 128 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm21637-201ENSMUST00000105124 778 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm3055-201ENSMUST00000105316 720 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Scimp-202ENSMUST00000108534 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm12683-201ENSMUST00000117528 415 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm8430-201ENSMUST00000119780 471 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm15791-201ENSMUST00000120365 319 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 9030622O22Rik-201ENSMUST00000129082 1245 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 4930563I02Rik-202ENSMUST00000154835 971 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm24002-201ENSMUST00000158456 104 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Airn-203ENSMUST00000159791 485 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 B230216N24Rik-204ENSMUST00000161661 719 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm8214-201ENSMUST00000172123 351 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps62-201ENSMUST00000173275 910 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm5511-201ENSMUST00000189380 802 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm43308-201ENSMUST00000197236 373 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm44403-201ENSMUST00000198554 129 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm43967-201ENSMUST00000203787 301 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm32453-201ENSMUST00000204183 456 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm18791-201ENSMUST00000204611 726 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 CT486006.1-201ENSMUST00000216797 227 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Selenok-ps6-201ENSMUST00000221812 283 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 AC131743.3-201ENSMUST00000222099 662 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Diaph3-206ENSMUST00000226745 713 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Zfp781-201ENSMUST00000076281 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Rps27a-ps2-201ENSMUST00000078766 467 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Fpr-rs7-201ENSMUST00000095637 1017 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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