Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm12787-201ENSMUST00000119234 396 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm12438-201ENSMUST00000122034 336 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm16157-201ENSMUST00000124813 534 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 1700054M17Rik-201ENSMUST00000125654 445 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 4930511O05Rik-201ENSMUST00000155912 391 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm25334-201ENSMUST00000158036 110 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Calml4-202ENSMUST00000163820 699 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Lrrc4-202ENSMUST00000171353 883 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Pafah1b1-ps1-201ENSMUST00000181263 1046 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm27161-201ENSMUST00000183960 562 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm28665-201ENSMUST00000189269 670 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm21735-201ENSMUST00000190360 696 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm412-201ENSMUST00000193360 948 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm9710-201ENSMUST00000198053 499 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm17956-201ENSMUST00000199931 838 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 AC171206.1-201ENSMUST00000213612 213 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm18487-201ENSMUST00000215826 878 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 CT025606.1-201ENSMUST00000218273 324 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 AC138290.2-201ENSMUST00000218822 369 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 AC134917.2-201ENSMUST00000223354 124 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 AC129085.4-201ENSMUST00000224536 570 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Nqo2-202ENSMUST00000058978 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm23515-201ENSMUST00000082829 107 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm23733-201ENSMUST00000083750 106 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Krtap14-201ENSMUST00000099562 216 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Zfp712-201ENSMUST00000167565 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Adgrb3-201ENSMUST00000041838 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Il1f5-201ENSMUST00000028360 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Cd160-202ENSMUST00000107074 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 AC164437.5-201ENSMUST00000227235 4414 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm8267-201ENSMUST00000165003 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Zfp385b-211ENSMUST00000171063 2668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Prkd3-201ENSMUST00000003191 5517 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 AC174797.5-201ENSMUST00000225055 1860 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Il1rl1-201ENSMUST00000053043 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Rpusd2Q149F1 Gm11268-201ENSMUST00000118347 267 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
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Rpusd2Q149F1 Gm5405-201ENSMUST00000120478 609 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Olfr1379-ps1-201ENSMUST00000120726 1001 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
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Rpusd2Q149F1 Gm8220-202ENSMUST00000169601 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Rpusd2Q149F1 Gm21775-201ENSMUST00000178669 540 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Rpusd2Q149F1 Il5ra-203ENSMUST00000205004 2271 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Rpusd2Q149F1 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Rpusd2Q149F1 Tph1-201ENSMUST00000049298 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm15328-201ENSMUST00000144006 2977 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm13881-201ENSMUST00000149025 3716 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Olfr1444-202ENSMUST00000213606 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Fus-202ENSMUST00000079045 2623 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm30211-201ENSMUST00000197227 3078 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Olfr1340-202ENSMUST00000213436 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Cmtr2-201ENSMUST00000056972 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Mgat4a-206ENSMUST00000154819 2796 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Platr23-201ENSMUST00000180797 2439 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm23691-201ENSMUST00000101878 107 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms