Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Ear-ps5-201ENSMUST00000164700 463 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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Sh3bp1P55194 Gm3141-201ENSMUST00000168726 499 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm17102-201ENSMUST00000170929 906 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Mir3110-201ENSMUST00000175053 80 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm29284-201ENSMUST00000188363 255 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm18177-201ENSMUST00000188373 404 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm28389-201ENSMUST00000190090 697 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 1700084F23Rik-205ENSMUST00000191362 743 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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Sh3bp1P55194 4930540E01Rik-201ENSMUST00000192569 1146 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm43828-201ENSMUST00000196890 639 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Rrh-208ENSMUST00000200079 1106 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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Sh3bp1P55194 Gm44796-201ENSMUST00000205272 626 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm44865-201ENSMUST00000207240 531 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Olfr1488-ps1-201ENSMUST00000207436 136 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm30790-201ENSMUST00000208256 958 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 4930448C13Rik-204ENSMUST00000221610 1044 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 AC192334.1-201ENSMUST00000221832 1268 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 AC154618.1-201ENSMUST00000227451 303 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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Sh3bp1P55194 Stfa2-201ENSMUST00000023619 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Prl3b1-201ENSMUST00000035273 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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Sh3bp1P55194 Gm6288-201ENSMUST00000100778 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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Sh3bp1P55194 Slfn8-201ENSMUST00000038141 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 9230019H11Rik-201ENSMUST00000095874 2801 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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Sh3bp1P55194 Gm44000-201ENSMUST00000205038 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Rnf213-201ENSMUST00000093902 16716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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Sh3bp1P55194 Rnf148-201ENSMUST00000104979 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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Sh3bp1P55194 Gm15161-201ENSMUST00000117340 387 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm11826-201ENSMUST00000118781 438 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm16200-201ENSMUST00000120385 331 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm13537-201ENSMUST00000120467 267 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm13738-201ENSMUST00000122437 469 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Sspnos-201ENSMUST00000139089 826 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sh3bp1P55194 Gm21973-201ENSMUST00000157020 358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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