Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm11631-201ENSMUST00000119220 156 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm3788-201ENSMUST00000119949 136 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm12041-201ENSMUST00000121606 602 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm25572-201ENSMUST00000157527 172 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm24939-201ENSMUST00000158325 137 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Snrpe-201ENSMUST00000164096 669 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Lipo1-202ENSMUST00000178735 1188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm6802-202ENSMUST00000186566 126 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm28136-206ENSMUST00000189800 1104 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm18183-201ENSMUST00000191024 615 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm44485-201ENSMUST00000199569 137 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm45499-201ENSMUST00000211656 280 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprkP35822 AC129202.3-201ENSMUST00000224413 733 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Olfr944-201ENSMUST00000079650 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprkP35822 4930512M02Rik-201ENSMUST00000081896 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Mir383-201ENSMUST00000083523 70 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Usp29-204ENSMUST00000200535 7540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Olfr615-203ENSMUST00000215673 3469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Zfp369-202ENSMUST00000126879 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Olfr1321-202ENSMUST00000215373 4482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Dmxl1-201ENSMUST00000041772 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Olfr1353-201ENSMUST00000039718 1992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Atp8b4-202ENSMUST00000040149 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Lin7c-201ENSMUST00000028583 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Slc22a27-201ENSMUST00000075619 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Agbl1-201ENSMUST00000026854 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Ighv1-77-201ENSMUST00000170551 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Zfp456-202ENSMUST00000172266 679 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm25817-201ENSMUST00000177758 121 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm24766-201ENSMUST00000179182 121 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm27940-201ENSMUST00000184449 98 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm5660-201ENSMUST00000197453 1149 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PtprkP35822 AC133207.3-201ENSMUST00000217694 464 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtprkP35822 AC153526.4-201ENSMUST00000217713 379 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm30624-201ENSMUST00000220039 628 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Mir26a-2-201ENSMUST00000083496 84 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Zfp182-202ENSMUST00000115333 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Kcnrg-201ENSMUST00000051184 1766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Clcn3-202ENSMUST00000056508 5684 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Olfr190-203ENSMUST00000216495 8240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Vmn2r-ps11-201ENSMUST00000176568 2730 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Dennd4c-204ENSMUST00000142837 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm12820-201ENSMUST00000119233 342 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Phospho2-206ENSMUST00000180290 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm37588-201ENSMUST00000195024 2496 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm43101-202ENSMUST00000201733 488 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm4045-201ENSMUST00000204076 310 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprkP35822 4930503L19Rik-202ENSMUST00000211817 913 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Olfr893-202ENSMUST00000211975 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Olfr231-202ENSMUST00000214446 5204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprkP35822 AC122448.1-201ENSMUST00000226317 772 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Fras1-201ENSMUST00000036019 15848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprkP35822 2310001H17Rik-203ENSMUST00000181517 3981 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Slc7a2-203ENSMUST00000117077 7626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Dnah11-201ENSMUST00000084806 14072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Acsm3-205ENSMUST00000106529 3295 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Celf2-201ENSMUST00000002176 7718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Olfr531-204ENSMUST00000217167 3874 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Lrrtm4-202ENSMUST00000126005 3733 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Igkv8-19-201ENSMUST00000103389 305 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm15034-201ENSMUST00000120043 349 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Olfr1035-ps1-201ENSMUST00000120109 966 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm22816-201ENSMUST00000157450 117 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm23638-201ENSMUST00000175073 126 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm23158-201ENSMUST00000175076 126 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm22907-201ENSMUST00000175198 126 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm22625-201ENSMUST00000175382 126 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm22875-201ENSMUST00000175449 126 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm25197-201ENSMUST00000175516 126 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm27857-201ENSMUST00000176930 126 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm26268-201ENSMUST00000177685 126 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm23681-201ENSMUST00000178821 126 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm19201-201ENSMUST00000210127 778 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Mir338-201ENSMUST00000083666 98 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Olfr859-201ENSMUST00000086480 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Kcnu1-201ENSMUST00000098858 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm43605-201ENSMUST00000199663 3426 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Sult6b1-204ENSMUST00000169544 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Zp3r-201ENSMUST00000039862 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Olfr191-202ENSMUST00000215647 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Lama2-201ENSMUST00000092639 9614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PtprkP35822 AC112274.1-201ENSMUST00000218957 4274 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm42955-201ENSMUST00000197355 3393 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Olfr300-ps1-201ENSMUST00000174262 2395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm42992-201ENSMUST00000197043 6836 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm40621-202ENSMUST00000217378 1470 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PtprkP35822 AI987944-201ENSMUST00000071804 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm9611-201ENSMUST00000100698 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm25595-201ENSMUST00000102273 97 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
PtprkP35822 Gm3633-202ENSMUST00000163102 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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