Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Gm23883-201ENSMUST00000122686 290 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Gm13610-201ENSMUST00000128298 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Hnf1aos2-201ENSMUST00000138108 442 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Gm26312-201ENSMUST00000157769 165 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Ctla2b-202ENSMUST00000171347 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Gm6882-201ENSMUST00000177741 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Gm25019-201ENSMUST00000179732 110 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RxrgP28705 6330403N20Rik-201ENSMUST00000180467 1189 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RxrgP28705 1810026B05Rik-201ENSMUST00000183916 432 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Gm21803-201ENSMUST00000188897 693 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RxrgP28705 1700047L14Rik-201ENSMUST00000189659 511 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Gm2053-201ENSMUST00000195671 631 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Gm9317-201ENSMUST00000197055 862 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Gm42502-201ENSMUST00000198550 1089 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Gm18855-201ENSMUST00000206689 570 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Gm7128-201ENSMUST00000211639 533 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Gm45908-201ENSMUST00000212977 1177 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Gm19936-201ENSMUST00000216414 838 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RxrgP28705 AC153870.1-201ENSMUST00000219599 560 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Gm46430-203ENSMUST00000221389 1049 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RxrgP28705 CT010456.2-201ENSMUST00000222665 1053 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Spata19-201ENSMUST00000034473 697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Cd200r3-201ENSMUST00000048479 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Olfr1302-201ENSMUST00000054004 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Defb25-201ENSMUST00000099203 293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Sult1d1-201ENSMUST00000113314 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Gm26523-201ENSMUST00000180713 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Vmn1r34-202ENSMUST00000226262 2952 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Olfr362-202ENSMUST00000213817 4059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Rabgap1-202ENSMUST00000066055 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Gm38374-201ENSMUST00000194417 2033 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Gm42923-201ENSMUST00000198438 2896 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Gm15581-201ENSMUST00000131334 5640 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Rbm46os-201ENSMUST00000131274 3261 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Scel-201ENSMUST00000095576 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Gm44829-201ENSMUST00000208008 3193 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Gm44897-201ENSMUST00000206187 1341 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Olfr1449-203ENSMUST00000214079 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Gm13575-201ENSMUST00000142353 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Zfp101-201ENSMUST00000167107 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 AY512915-203ENSMUST00000159937 3650 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Vmn1r171-209ENSMUST00000228228 2863 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Zfp119b-202ENSMUST00000189452 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Trbv3-201ENSMUST00000103264 455 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Gm24935-201ENSMUST00000103770 110 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 n-R5s82-201ENSMUST00000104213 109 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Gm14790-201ENSMUST00000117760 1293 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Gm11550-201ENSMUST00000118210 699 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Gm11212-201ENSMUST00000118337 618 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Gm13363-201ENSMUST00000122008 522 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Gm15022-201ENSMUST00000122074 746 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Gm15885-201ENSMUST00000122114 388 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Gm15274-201ENSMUST00000131442 291 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Gm14012-201ENSMUST00000136025 677 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Gm21979-201ENSMUST00000139887 291 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Gm7846-201ENSMUST00000145844 274 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Gm15259-201ENSMUST00000151262 291 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Gm16300-201ENSMUST00000160031 1279 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Gm17732-201ENSMUST00000163259 821 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Vmn1r122-201ENSMUST00000164409 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Vmn1r159-201ENSMUST00000167871 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Pkib-209ENSMUST00000177325 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 5730522E02Rik-208ENSMUST00000179180 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Gm5849-201ENSMUST00000180151 351 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Gm27543-201ENSMUST00000183562 177 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Gm2950-201ENSMUST00000185530 520 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Gm29387-201ENSMUST00000189074 623 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Gm28701-201ENSMUST00000189778 1010 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Gm37837-201ENSMUST00000191743 604 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 7420461P10Rik-203ENSMUST00000193898 545 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Gm22897-201ENSMUST00000197860 128 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Gm31510-202ENSMUST00000206795 239 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 AC160061.1-201ENSMUST00000217766 533 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 AC159622.3-201ENSMUST00000221010 361 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Prl3b1-201ENSMUST00000035273 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Spink13-201ENSMUST00000097557 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Ttc39d-201ENSMUST00000053168 2022 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Gm44678-201ENSMUST00000207828 2775 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 A430027C01Rik-201ENSMUST00000194599 1644 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Cc2d2b-203ENSMUST00000207801 3730 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Vmn1r81-204ENSMUST00000228482 13495 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Clec9a-201ENSMUST00000058352 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Gm36962-201ENSMUST00000192114 1761 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Vmn1r202-202ENSMUST00000228020 5441 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Ube2u-202ENSMUST00000133493 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Tbc1d32-201ENSMUST00000099739 7240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Vmn1r217-202ENSMUST00000227110 9888 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Olfr353-203ENSMUST00000217215 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Olfr738-203ENSMUST00000214853 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Vmn2r89-202ENSMUST00000159734 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Mlip-205ENSMUST00000183955 3069 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Gm884-201ENSMUST00000059279 10977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
RxrgP28705 Wwp1-201ENSMUST00000035982 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms