Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 A430027C01Rik-201ENSMUST00000194599 1644 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RxraP28700 5830405F06Rik-201ENSMUST00000192753 1755 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RxraP28700 Vmn1r34-202ENSMUST00000226262 2952 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm25595-201ENSMUST00000102273 97 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm15021-201ENSMUST00000117832 742 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm14082-201ENSMUST00000118582 801 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm11759-201ENSMUST00000121742 464 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RxraP28700 n-R5s24-201ENSMUST00000122518 117 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm12569-202ENSMUST00000126189 796 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm14223-201ENSMUST00000146060 517 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm26489-201ENSMUST00000157880 264 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RxraP28700 Iqch-204ENSMUST00000163982 3375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm17043-201ENSMUST00000164621 1283 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RxraP28700 Obox3-ps5-201ENSMUST00000176412 1003 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm27960-201ENSMUST00000183445 184 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm37839-201ENSMUST00000192576 492 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm36939-201ENSMUST00000194889 439 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm38172-201ENSMUST00000195321 567 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm5885-202ENSMUST00000203357 528 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RxraP28700 AC123835.1-201ENSMUST00000214362 670 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RxraP28700 AC139638.1-201ENSMUST00000218027 364 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RxraP28700 RMST_1.1-205ENSMUST00000218060 997 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm19195-201ENSMUST00000222018 511 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm9202-201ENSMUST00000223036 437 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RxraP28700 CT009733.1-201ENSMUST00000225322 425 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RxraP28700 AC154436.2-201ENSMUST00000227408 208 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RxraP28700 Ms4a7-201ENSMUST00000025574 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RxraP28700 Tas2r103-201ENSMUST00000032317 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RxraP28700 3830403N18Rik-201ENSMUST00000033458 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RxraP28700 BC049715-201ENSMUST00000052702 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RxraP28700 Vmn1r49-201ENSMUST00000071865 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RxraP28700 Olfr859-201ENSMUST00000086480 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RxraP28700 Olfr262-201ENSMUST00000087818 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RxraP28700 Ndst4-205ENSMUST00000174648 4996 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RxraP28700 Vmn2r17-201ENSMUST00000171841 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RxraP28700 Cul3-202ENSMUST00000164108 2442 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm43333-201ENSMUST00000198340 2262 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RxraP28700 Zscan4a-201ENSMUST00000210573 2279 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RxraP28700 Kcnt2-202ENSMUST00000120709 5790 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
RxraP28700 Olfr78-201ENSMUST00000060187 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm9577-201ENSMUST00000174655 2620 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
RxraP28700 Vmn2r85-201ENSMUST00000171811 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RxraP28700 Olfr1387-202ENSMUST00000214541 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RxraP28700 Zfp759-201ENSMUST00000052716 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm37244-201ENSMUST00000191748 1981 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RxraP28700 Crebrf-201ENSMUST00000062519 7462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm22266-201ENSMUST00000104011 138 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm15159-201ENSMUST00000117062 764 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm13077-201ENSMUST00000121941 484 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm23121-201ENSMUST00000157653 173 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm24940-201ENSMUST00000158326 108 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RxraP28700 AY512915-204ENSMUST00000162315 676 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RxraP28700 Vmn1r-ps66-201ENSMUST00000173436 612 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm20389-201ENSMUST00000174217 1006 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RxraP28700 Vmn1r-ps145-201ENSMUST00000175863 424 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RxraP28700 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm18397-201ENSMUST00000176704 587 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm20619-205ENSMUST00000181633 581 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm27409-201ENSMUST00000184727 80 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm7634-201ENSMUST00000185778 553 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gbp2-ps-201ENSMUST00000198870 1269 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm43015-201ENSMUST00000199087 565 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm42796-201ENSMUST00000199913 1087 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RxraP28700 Bsph1-202ENSMUST00000204715 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RxraP28700 AC161456.1-201ENSMUST00000206771 887 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RxraP28700 1700095K22Rik-201ENSMUST00000206808 282 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm44773-201ENSMUST00000207374 557 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RxraP28700 Olfr654-202ENSMUST00000210457 1156 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm45494-201ENSMUST00000211167 545 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RxraP28700 Mir670hg-207ENSMUST00000211619 819 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm7639-201ENSMUST00000212608 484 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm3800-201ENSMUST00000221086 554 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm3086-202ENSMUST00000221248 310 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
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RxraP28700 AC158392.1-201ENSMUST00000223720 1069 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RxraP28700 AC151907.1-201ENSMUST00000228812 412 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RxraP28700 Skint2-201ENSMUST00000058791 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RxraP28700 Olfr816-201ENSMUST00000071605 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm23302-201ENSMUST00000082710 100 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RxraP28700 n-R5s86-201ENSMUST00000083215 119 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm22155-201ENSMUST00000083836 162 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RxraP28700 Olfr654-201ENSMUST00000098173 1155 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RxraP28700 Zfp811-201ENSMUST00000080905 1656 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm37738-201ENSMUST00000192396 4716 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RxraP28700 Il6-203ENSMUST00000199183 2343 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RxraP28700 Tmem207-201ENSMUST00000165687 1538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RxraP28700 Olfr203-202ENSMUST00000215893 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm15581-201ENSMUST00000131334 5640 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RxraP28700 AC159308.1-201ENSMUST00000216615 1351 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RxraP28700 Clk4-203ENSMUST00000109113 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RxraP28700 Glcci1-206ENSMUST00000162567 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm18163-201ENSMUST00000197877 1643 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RxraP28700 Nxt2-202ENSMUST00000112913 2538 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RxraP28700 3222401L13Rik-202ENSMUST00000192137 6292 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RxraP28700 Gm43443-201ENSMUST00000202337 2393 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RxraP28700 Slc19a3-201ENSMUST00000045560 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 Olfr1305-202ENSMUST00000213405 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RxraP28700 Olfr690-203ENSMUST00000216230 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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