Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm5935-201ENSMUST00000101667 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Ighv5-16-201ENSMUST00000103458 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm26422-201ENSMUST00000104276 132 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Stk36-203ENSMUST00000113694 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm13331-201ENSMUST00000117500 448 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm13176-201ENSMUST00000117910 477 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm13013-201ENSMUST00000119087 523 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm14731-201ENSMUST00000119216 376 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm15168-201ENSMUST00000121057 316 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Sult2a-ps2-201ENSMUST00000121135 405 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm14038-201ENSMUST00000121500 807 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm15164-201ENSMUST00000122203 271 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm25325-201ENSMUST00000122559 86 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Mir1903-201ENSMUST00000122574 80 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Hmgb4os-201ENSMUST00000131581 518 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm12256-201ENSMUST00000132394 446 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm12259-201ENSMUST00000138391 328 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm17223-201ENSMUST00000171413 481 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm26746-201ENSMUST00000181722 487 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 4930461G14Rik-201ENSMUST00000181967 843 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm18447-201ENSMUST00000187501 307 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm28763-201ENSMUST00000188870 166 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm29579-201ENSMUST00000190820 166 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm43516-201ENSMUST00000196891 322 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Ghrl-202ENSMUST00000203363 400 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm45004-201ENSMUST00000205302 465 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm44523-201ENSMUST00000205616 417 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 4930567H12Rik-202ENSMUST00000212512 766 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 AL669916.3-201ENSMUST00000213855 94 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 AL669916.6-201ENSMUST00000214610 94 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 AL669916.4-201ENSMUST00000215976 94 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 CAAA01125382.4-201ENSMUST00000217222 774 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 AL669916.1-201ENSMUST00000217640 94 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 AC153924.1-201ENSMUST00000220117 312 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm46996-201ENSMUST00000220924 408 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 AC167192.2-201ENSMUST00000224794 198 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 AC131745.2-201ENSMUST00000225736 565 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 4930522N08Rik-201ENSMUST00000031274 916 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm4792-201ENSMUST00000065826 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Olfr748-201ENSMUST00000073561 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Gm22423-201ENSMUST00000082861 184 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Zfp867-201ENSMUST00000057799 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Hoxd9P28357 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm28320-201ENSMUST00000187777 2273 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Ctnna3-202ENSMUST00000105440 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 C030005K15Rik-201ENSMUST00000166373 1882 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Atp6v1g3-201ENSMUST00000027643 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Olfr802-203ENSMUST00000217576 5297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Xpo4-201ENSMUST00000089482 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 AC107232.1-201ENSMUST00000227785 1503 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Catsperg1-201ENSMUST00000047846 3566 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Scaper-201ENSMUST00000037408 5158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Ifi202b-201ENSMUST00000000266 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Igkv4-57-1-201ENSMUST00000103356 373 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Snord72-201ENSMUST00000104549 81 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Cav1-203ENSMUST00000115454 613 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Spin2-ps2-201ENSMUST00000116186 778 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm15364-201ENSMUST00000119618 585 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Serf1-202ENSMUST00000129014 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm6133-201ENSMUST00000164064 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Trbv10-201ENSMUST00000168322 289 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm21828-201ENSMUST00000178050 543 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm21866-201ENSMUST00000178428 543 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm21725-201ENSMUST00000178519 543 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm21800-201ENSMUST00000178559 543 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm21852-201ENSMUST00000179125 543 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm21764-201ENSMUST00000179219 543 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm21891-201ENSMUST00000179284 543 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm21904-201ENSMUST00000179522 543 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm26579-201ENSMUST00000181656 918 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Hoxd9P28357 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
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