Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Olfr633-202ENSMUST00000216006 3915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Vmn1r1-203ENSMUST00000227629 3654 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Cep290-206ENSMUST00000219765 7985 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 5930435M05Rik-201ENSMUST00000207572 3712 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm3278-201ENSMUST00000164459 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Olfr378-201ENSMUST00000069790 1508 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Olfr1123-203ENSMUST00000216208 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Lrriq3-202ENSMUST00000192383 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Olfr951-202ENSMUST00000216107 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Ptgs2-201ENSMUST00000035065 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm23709-201ENSMUST00000104364 130 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Prl2c1-202ENSMUST00000110335 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm11971-201ENSMUST00000117715 288 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm12901-201ENSMUST00000118690 532 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm13815-201ENSMUST00000119963 412 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm5391-201ENSMUST00000121155 613 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 2210408F21Rik-202ENSMUST00000124811 384 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm13180-201ENSMUST00000141222 440 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 1700061J23Rik-201ENSMUST00000141678 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 4930440I19Rik-201ENSMUST00000144728 992 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm15414-201ENSMUST00000155217 440 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm26098-201ENSMUST00000157247 288 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm24774-201ENSMUST00000157384 134 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm23700-201ENSMUST00000158842 102 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Olfr723-201ENSMUST00000164157 1006 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm17044-201ENSMUST00000168549 828 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Vmn1r-ps55-201ENSMUST00000174634 392 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm20545-201ENSMUST00000174739 210 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm3307-201ENSMUST00000176164 632 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm23450-201ENSMUST00000178285 91 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Nutf2-ps2-201ENSMUST00000179225 384 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm26828-201ENSMUST00000180640 172 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Rian-217ENSMUST00000183266 687 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm27457-201ENSMUST00000184771 156 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm28830-201ENSMUST00000188192 213 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm28467-201ENSMUST00000190981 318 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm36971-201ENSMUST00000195244 378 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm7838-201ENSMUST00000203221 1189 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Olfr723-202ENSMUST00000206058 1078 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm45171-201ENSMUST00000206360 736 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm45261-201ENSMUST00000211023 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Camta1-213ENSMUST00000214673 243 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 AC152979.3-201ENSMUST00000217720 479 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 AC125539.2-202ENSMUST00000227983 587 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 AC125539.2-201ENSMUST00000228339 753 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 AC131178.1-201ENSMUST00000228649 492 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Olfr724-201ENSMUST00000075030 1006 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm24525-201ENSMUST00000082917 151 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Fpr-rs7-201ENSMUST00000095637 1017 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm43386-201ENSMUST00000199654 4001 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm9921-201ENSMUST00000173293 4399 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm43166-201ENSMUST00000202871 4379 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Olfr270-204ENSMUST00000215127 3145 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Ints12-201ENSMUST00000029650 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm37461-201ENSMUST00000193929 3704 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Usp9x-201ENSMUST00000089302 11887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Serpinb3a-201ENSMUST00000027567 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm45853-201ENSMUST00000212310 3171 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Kcnj1-201ENSMUST00000047334 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm43185-201ENSMUST00000197507 2775 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 AC113059.3-201ENSMUST00000217423 2777 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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Ccl20O89093 Vmn2r20-201ENSMUST00000172199 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Btbd35f1-201ENSMUST00000178070 1955 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Zscan4b-201ENSMUST00000168158 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Olfr613-201ENSMUST00000106888 5139 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Ptgs2os-202ENSMUST00000181915 2937 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm43588-201ENSMUST00000201862 2298 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Zfp426-201ENSMUST00000080386 2417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm37696-201ENSMUST00000194223 3349 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Olfr655-203ENSMUST00000215538 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Olfr655-204ENSMUST00000216750 2010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Vmn2r51-201ENSMUST00000094863 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Fnbp1l-203ENSMUST00000162947 1830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Vmn1r124-201ENSMUST00000105200 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm10964-201ENSMUST00000106852 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Ncald-202ENSMUST00000116445 858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm8145-201ENSMUST00000118220 745 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm15017-201ENSMUST00000141989 632 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm16345-201ENSMUST00000146065 158 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm22968-201ENSMUST00000157955 118 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm16545-201ENSMUST00000161968 463 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm4675-201ENSMUST00000163396 502 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Vmn1r-ps29-201ENSMUST00000174862 785 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Vmn1r-ps21-201ENSMUST00000176891 925 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Mir6343-201ENSMUST00000183584 84 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm29356-201ENSMUST00000186935 373 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm18342-201ENSMUST00000186987 694 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm28514-201ENSMUST00000187488 450 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm2427-201ENSMUST00000189121 881 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 1700063I16Rik-201ENSMUST00000194611 611 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Cycs-ps2-201ENSMUST00000197114 292 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 AC166902.1-201ENSMUST00000216653 517 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm19256-201ENSMUST00000218550 231 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccl20O89093 Gm6474-201ENSMUST00000223250 699 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
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