Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gm37589-201ENSMUST00000193609 3994 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Ccr9-204ENSMUST00000168910 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Vmn2r-ps42-201ENSMUST00000174123 2083 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Olfr1297-202ENSMUST00000213398 6998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm38101-201ENSMUST00000193484 3557 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Trav15n-1-201ENSMUST00000103590 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Traj25-201ENSMUST00000103716 57 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Trac-201ENSMUST00000103740 413 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm22468-201ENSMUST00000116680 120 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm26248-201ENSMUST00000116700 121 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm26137-201ENSMUST00000116701 121 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm26190-201ENSMUST00000116704 121 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm24617-201ENSMUST00000116705 121 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm25778-201ENSMUST00000116713 121 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm25774-201ENSMUST00000116717 121 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm22102-201ENSMUST00000116730 121 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm23177-201ENSMUST00000116784 121 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm24193-201ENSMUST00000116801 121 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm24744-201ENSMUST00000116833 121 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm24427-201ENSMUST00000116896 121 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm22346-201ENSMUST00000116918 121 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm23606-201ENSMUST00000116938 121 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm22029-201ENSMUST00000116940 121 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm26298-201ENSMUST00000116956 121 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm23844-201ENSMUST00000116959 121 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm24484-201ENSMUST00000117009 121 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm25347-201ENSMUST00000117026 121 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm22112-201ENSMUST00000117032 121 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Olfr475-ps1-201ENSMUST00000117982 932 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm15791-201ENSMUST00000120365 319 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Olfr337-ps1-201ENSMUST00000120380 456 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm5383-201ENSMUST00000121177 617 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm7973-201ENSMUST00000122107 488 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 1700007M16Rik-201ENSMUST00000129075 435 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Bloc1s1-202ENSMUST00000131271 475 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm12519-201ENSMUST00000134099 693 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm13180-201ENSMUST00000141222 440 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm15687-201ENSMUST00000141440 269 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm11466-201ENSMUST00000148017 291 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm23327-201ENSMUST00000157420 78 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm23965-201ENSMUST00000157969 142 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 B230216N24Rik-204ENSMUST00000161661 719 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm6632-201ENSMUST00000168425 954 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm22991-201ENSMUST00000178126 121 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm25754-201ENSMUST00000178653 121 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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H2-M1F7CXU4 Gm25208-201ENSMUST00000178964 121 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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H2-M1F7CXU4 Gm21241-201ENSMUST00000179551 934 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm23943-201ENSMUST00000179712 121 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm25228-201ENSMUST00000180121 121 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm23304-201ENSMUST00000180209 121 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Trav15d-1-dv6d-1-202ENSMUST00000186370 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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H2-M1F7CXU4 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Mrgprb9-ps-201ENSMUST00000188739 892 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
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H2-M1F7CXU4 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
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H2-M1F7CXU4 Gm44646-201ENSMUST00000205847 421 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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H2-M1F7CXU4 AC139294.2-201ENSMUST00000227159 285 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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H2-M1F7CXU4 AC121978.1-201ENSMUST00000228357 380 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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H2-M1F7CXU4 Olfr749-201ENSMUST00000074674 1016 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Olfr345-201ENSMUST00000076850 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Rpl36a-ps1-201ENSMUST00000081987 449 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Olfr1111-201ENSMUST00000099860 940 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm17791-201ENSMUST00000185660 1501 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm44433-201ENSMUST00000203540 4832 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Tfec-201ENSMUST00000031533 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Slc22a22-201ENSMUST00000022995 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 3222401L13Rik-202ENSMUST00000192137 6292 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Olfr459-202ENSMUST00000214752 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm37205-201ENSMUST00000194820 2736 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Trim38-201ENSMUST00000074067 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Ndst4-205ENSMUST00000174648 4996 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Herc2-201ENSMUST00000076226 15250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
H2-M1F7CXU4 Gm45066-201ENSMUST00000207528 2551 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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