Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC110381.1-201ENSMUST00000218987 586 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154576.1-201ENSMUST00000225864 563 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC133517.2-201ENSMUST00000226820 690 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr68-201ENSMUST00000072513 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr749-201ENSMUST00000074674 1016 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6065-201ENSMUST00000081336 492 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snora52-201ENSMUST00000082732 137 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 n-R5s167-201ENSMUST00000083227 121 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26163-201ENSMUST00000083792 178 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22155-201ENSMUST00000083836 162 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fpr-rs7-201ENSMUST00000095637 1017 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6043-201ENSMUST00000099961 492 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccr9-205ENSMUST00000180093 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4631-202ENSMUST00000121393 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5117-201ENSMUST00000178878 2553 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyld-204ENSMUST00000209206 4032 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r47-203ENSMUST00000227811 6792 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vav3-202ENSMUST00000106576 3123 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgsl1-201ENSMUST00000124558 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2396-202ENSMUST00000188232 3433 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Casp4-201ENSMUST00000027012 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44283-201ENSMUST00000204461 3950 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14520-201ENSMUST00000119258 387 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps18-ps2-201ENSMUST00000119493 398 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16347-201ENSMUST00000131707 622 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15414-201ENSMUST00000155217 440 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r-ps29-201ENSMUST00000174862 785 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26828-201ENSMUST00000180640 172 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC166902.1-201ENSMUST00000216653 517 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC158803.3-201ENSMUST00000220024 211 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6056-201ENSMUST00000221253 488 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC121804.2-201ENSMUST00000222531 316 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc31a1-202ENSMUST00000122092 4154 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm31747-201ENSMUST00000204638 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12289-201ENSMUST00000130860 2235 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28488-203ENSMUST00000188792 1498 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jmjd1c-206ENSMUST00000173689 8609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp644-203ENSMUST00000112695 1915 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4166-201ENSMUST00000220893 2996 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm30524-201ENSMUST00000204271 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8995-201ENSMUST00000184842 7280 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43605-201ENSMUST00000199663 3426 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc5a12-201ENSMUST00000045972 3529 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20515-201ENSMUST00000174440 4824 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trbv13-3-201ENSMUST00000103271 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1292-ps1-201ENSMUST00000118137 939 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14930-201ENSMUST00000118864 652 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15166-201ENSMUST00000120790 385 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6031-201ENSMUST00000121314 1054 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14784-201ENSMUST00000121604 663 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16189-201ENSMUST00000123707 997 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16222-201ENSMUST00000124320 1298 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16254-201ENSMUST00000131528 730 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26153-201ENSMUST00000157433 127 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23700-201ENSMUST00000158842 102 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r175-201ENSMUST00000166141 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r-ps68-201ENSMUST00000173880 861 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r-ps21-201ENSMUST00000176891 925 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29509-201ENSMUST00000185716 321 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700027A15Rik-201ENSMUST00000185768 321 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrgprb13-201ENSMUST00000188191 985 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28830-201ENSMUST00000188192 213 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9443-201ENSMUST00000188406 816 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700023G09Rik-202ENSMUST00000194671 308 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5284-201ENSMUST00000199053 903 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43596-201ENSMUST00000202818 884 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2926-201ENSMUST00000205625 239 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC158807.1-201ENSMUST00000217959 187 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36372-201ENSMUST00000221011 778 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 AL671874.1-201ENSMUST00000223746 1123 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC125399.1-201ENSMUST00000224236 595 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154724.1-201ENSMUST00000225782 821 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC131997.2-201ENSMUST00000227452 362 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10145-201ENSMUST00000077776 462 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir188-201ENSMUST00000083464 68 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 n-R5s27-201ENSMUST00000093699 119 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r17-201ENSMUST00000171841 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttc33-202ENSMUST00000081640 1583 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slfn8-203ENSMUST00000108152 3083 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr91-203ENSMUST00000217372 3809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 4932411N23Rik-201ENSMUST00000081074 3407 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr963-202ENSMUST00000215649 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38235-201ENSMUST00000194600 4952 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir680-3-201ENSMUST00000102298 87 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8424-201ENSMUST00000117716 988 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hspe1-ps6-201ENSMUST00000120275 283 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25179-201ENSMUST00000122632 128 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25103-201ENSMUST00000122671 318 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17025-201ENSMUST00000133273 580 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12259-201ENSMUST00000138391 328 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930440I19Rik-201ENSMUST00000144728 992 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25433-201ENSMUST00000158283 286 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10269-201ENSMUST00000165229 372 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.4 ms