Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Gabrb1-201ENSMUST00000031122 13737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Parp4-201ENSMUST00000161553 6387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Olfr1252-202ENSMUST00000213196 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Cdh10-202ENSMUST00000166873 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Nsun6-201ENSMUST00000028034 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Vmn2r77-201ENSMUST00000164996 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm11823-201ENSMUST00000130582 2278 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 AC129085.3-201ENSMUST00000225686 1705 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 AC164102.1-201ENSMUST00000220524 1553 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 AC166344.3-203ENSMUST00000228117 1466 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm37370-201ENSMUST00000191996 1410 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm7919-201ENSMUST00000202043 1389 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm37589-201ENSMUST00000193609 3994 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 AC164297.4-201ENSMUST00000224225 1307 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Pifo-201ENSMUST00000010280 956 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Igkv8-26-201ENSMUST00000103382 371 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm25422-201ENSMUST00000104219 129 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Olfr828-201ENSMUST00000104914 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm14931-201ENSMUST00000111079 253 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm9112-201ENSMUST00000113610 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Ncald-202ENSMUST00000116445 858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm12748-201ENSMUST00000120763 504 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Rps11-ps2-201ENSMUST00000121547 456 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm14162-201ENSMUST00000121985 601 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm13131-201ENSMUST00000122228 321 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 A230083N12Rik-201ENSMUST00000126646 572 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm15589-201ENSMUST00000144193 271 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 4930440I19Rik-201ENSMUST00000144728 992 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm24719-201ENSMUST00000157520 110 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm7152-201ENSMUST00000163570 605 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Sult3a2-201ENSMUST00000165904 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Rian-211ENSMUST00000182737 699 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm7496-201ENSMUST00000192573 1034 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm42428-201ENSMUST00000198677 302 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm32754-202ENSMUST00000199504 480 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm45910-201ENSMUST00000212493 1003 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 AC153954.2-201ENSMUST00000213811 287 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 AC091522.1-201ENSMUST00000213934 850 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Camta1-213ENSMUST00000214673 243 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 AC117237.1-201ENSMUST00000224035 395 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 AC158981.3-201ENSMUST00000226844 1024 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 AC107711.2-203ENSMUST00000227827 762 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Scn2a-201ENSMUST00000028377 8935 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Olfr788-201ENSMUST00000056961 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Fam183b-201ENSMUST00000060581 493 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Olfr476-201ENSMUST00000077249 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Vmn1r13-201ENSMUST00000078885 903 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Scgb1b2-201ENSMUST00000080635 424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Olfr1029-201ENSMUST00000082191 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Olfr313-201ENSMUST00000082220 1074 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Snora30-201ENSMUST00000083325 130 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm7995-201ENSMUST00000089789 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Olfr441-201ENSMUST00000095954 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 B3galt1-201ENSMUST00000042456 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Slc38a4-201ENSMUST00000023101 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Olfr906-202ENSMUST00000214344 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Cc2d2b-203ENSMUST00000207801 3730 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Olfr741-202ENSMUST00000205518 3406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Ncoa7-203ENSMUST00000213836 2989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Vmn1r27-202ENSMUST00000226666 2969 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Zfp143-202ENSMUST00000169638 2914 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Vmn2r60-201ENSMUST00000166447 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm19514-201ENSMUST00000206856 4489 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Dgkk-201ENSMUST00000067410 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm43333-201ENSMUST00000198340 2262 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Pot1a-203ENSMUST00000115330 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Tet1-201ENSMUST00000050826 13986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Spaca1-203ENSMUST00000108148 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Scgb1b22-ps-201ENSMUST00000116008 280 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm11774-201ENSMUST00000118601 293 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm15233-201ENSMUST00000118747 400 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm16100-201ENSMUST00000120489 231 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm14989-201ENSMUST00000120497 207 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm11369-201ENSMUST00000120812 318 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm15057-201ENSMUST00000121516 534 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm16126-201ENSMUST00000126025 589 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm23233-201ENSMUST00000157301 137 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm16055-201ENSMUST00000161366 626 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Eif3s6-ps2-201ENSMUST00000163304 219 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Olfr102-201ENSMUST00000169373 1027 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Pfdn5-208ENSMUST00000170627 330 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm42936-201ENSMUST00000174019 652 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Obox4-ps29-201ENSMUST00000175956 1134 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm28389-201ENSMUST00000190090 697 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm28902-201ENSMUST00000191531 215 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm37438-201ENSMUST00000192813 393 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 2610001A08Rik-201ENSMUST00000193315 867 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm20770-201ENSMUST00000193474 694 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm37336-202ENSMUST00000193705 468 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Prrt4B2RU40 Gm42437-201ENSMUST00000197263 923 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.3 ms