Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm6632-201ENSMUST00000168425 954 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps77-201ENSMUST00000174184 921 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps75-201ENSMUST00000174316 920 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm16456-201ENSMUST00000174431 920 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm20767-201ENSMUST00000179071 510 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm28769-201ENSMUST00000190176 615 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm37632-201ENSMUST00000191811 1142 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm37996-201ENSMUST00000191859 367 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm43015-201ENSMUST00000199087 565 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm43478-201ENSMUST00000200381 292 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm6590-201ENSMUST00000203343 687 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm43919-201ENSMUST00000204303 364 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm45690-201ENSMUST00000210775 246 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Olfr1133-202ENSMUST00000217368 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 AC153870.1-201ENSMUST00000219599 560 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 AC166358.4-201ENSMUST00000223030 105 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 CT025525.4-201ENSMUST00000227728 277 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Olfr345-201ENSMUST00000076850 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 4933403O08Rik-203ENSMUST00000164272 1517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Scn9a-206ENSMUST00000164384 7530 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Olfr124-202ENSMUST00000215168 4497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Ttc37-205ENSMUST00000224386 6976 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm44739-201ENSMUST00000205294 1426 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps120-201ENSMUST00000176341 2409 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Olfr18-203ENSMUST00000212943 2896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm37456-201ENSMUST00000193176 5837 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Bmp15-201ENSMUST00000024049 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 AC115910.1-201ENSMUST00000221188 4275 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Ctsm-202ENSMUST00000223778 1905 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Zfp811-201ENSMUST00000080905 1656 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Ttc29-203ENSMUST00000117845 650 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm16060-201ENSMUST00000153140 478 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm15600-201ENSMUST00000153522 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm26153-201ENSMUST00000157433 127 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm26312-201ENSMUST00000157769 165 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm24175-201ENSMUST00000158931 129 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Skint1-204ENSMUST00000162158 1260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm6717-201ENSMUST00000185549 838 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Olfr1391-201ENSMUST00000187509 938 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Il20-202ENSMUST00000188581 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm2497-201ENSMUST00000189539 601 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm37741-201ENSMUST00000191768 1256 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm18698-201ENSMUST00000192327 668 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm37908-201ENSMUST00000195828 470 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm43464-201ENSMUST00000198003 317 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm43151-201ENSMUST00000201093 657 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm35216-201ENSMUST00000203777 433 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm45083-201ENSMUST00000205216 712 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm4574-201ENSMUST00000207804 542 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Olfr1455-ps1-201ENSMUST00000208608 771 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm45701-201ENSMUST00000212049 235 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm19936-201ENSMUST00000216414 838 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 AC122901.2-201ENSMUST00000216926 285 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm5750-201ENSMUST00000218711 801 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm15624-203ENSMUST00000204811 3402 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm11674-201ENSMUST00000124855 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Olfr1493-ps1-202ENSMUST00000208667 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Rd3l-203ENSMUST00000189759 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Ctsj-202ENSMUST00000224224 1421 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Olfr427-202ENSMUST00000213832 3866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Olfr1217-203ENSMUST00000214022 3947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Pcsk2os2-201ENSMUST00000153878 3370 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Trpc5os-202ENSMUST00000178233 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Fam83b-201ENSMUST00000098546 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Slamf7-203ENSMUST00000192195 3975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Olfr395-202ENSMUST00000215690 4275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm29084-201ENSMUST00000185587 1452 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm5444-201ENSMUST00000065956 2468 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Iigp1-202ENSMUST00000066912 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Entpd1-201ENSMUST00000112231 4221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm42986-201ENSMUST00000201618 3385 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm45322-201ENSMUST00000211642 1361 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 4930444F02Rik-201ENSMUST00000215429 6871 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Trbv3-201ENSMUST00000103264 455 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Ighv1-36-201ENSMUST00000103513 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm23879-201ENSMUST00000116874 126 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm13213-201ENSMUST00000119668 474 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm12807-201ENSMUST00000121546 962 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Mageb6-ps-201ENSMUST00000126612 1032 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 AI662270-201ENSMUST00000142709 304 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm13411-201ENSMUST00000149429 414 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm23902-201ENSMUST00000157571 134 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Vmn1r166-201ENSMUST00000164045 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm8453-201ENSMUST00000167253 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm4498-201ENSMUST00000168580 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Vmn1r118-201ENSMUST00000172322 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Vmn1r139-202ENSMUST00000173668 753 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps22-201ENSMUST00000176017 900 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm8693-201ENSMUST00000178871 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Vmn1r138-201ENSMUST00000179206 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Vmn1r131-201ENSMUST00000179390 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Vmn1r111-201ENSMUST00000179511 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm27492-201ENSMUST00000185194 187 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm29492-201ENSMUST00000187124 457 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Grik3B1AS29 Gm36638-201ENSMUST00000193295 400 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms