Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Gm3242-201ENSMUST00000171273 485 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm18128-201ENSMUST00000172625 511 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Csnk2b-207ENSMUST00000174024 883 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Obox4-ps29-201ENSMUST00000175956 1134 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm26057-201ENSMUST00000178099 165 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm8604-201ENSMUST00000183150 965 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm27342-201ENSMUST00000183530 109 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm27428-201ENSMUST00000184289 110 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Mir6362-201ENSMUST00000184329 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm29563-201ENSMUST00000187249 496 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm29576-201ENSMUST00000188020 678 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm9775-201ENSMUST00000189402 331 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm28153-201ENSMUST00000189853 629 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm18775-201ENSMUST00000190763 586 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm28354-201ENSMUST00000190904 678 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm37503-201ENSMUST00000192088 319 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Ighv1-45-201ENSMUST00000193677 352 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 4930562F17Rik-201ENSMUST00000195279 960 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 AC157822.1-201ENSMUST00000196643 80 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 1700052H01Rik-202ENSMUST00000196973 429 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm43501-201ENSMUST00000202513 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm8774-201ENSMUST00000203621 692 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm44634-201ENSMUST00000206119 152 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Olfr187-201ENSMUST00000206428 978 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm7587-201ENSMUST00000207618 1021 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 4930405G09Rik-201ENSMUST00000207912 1060 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm30954-201ENSMUST00000208715 1210 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm45646-201ENSMUST00000210983 441 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm45593-201ENSMUST00000211415 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Olfr151-201ENSMUST00000211893 1128 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 AC152414.2-201ENSMUST00000219620 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 AC156803.1-201ENSMUST00000224407 820 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 AC160980.2-201ENSMUST00000225131 949 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Tslp-201ENSMUST00000025237 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Olfr103-201ENSMUST00000058826 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Tas2r118-201ENSMUST00000062463 900 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Olfr732-201ENSMUST00000071208 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Olfr782-201ENSMUST00000077024 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Olfr99-201ENSMUST00000077585 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 n-R5s180-201ENSMUST00000082770 106 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 n-R5s205-201ENSMUST00000083149 125 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm1604b-201ENSMUST00000089120 357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Olfr893-201ENSMUST00000093867 942 ntAPPRIS P2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Vdac3-ps1-201ENSMUST00000099736 853 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Olfr1220-201ENSMUST00000099789 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Olfr1220-202ENSMUST00000099806 1201 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 AC120375.2-201ENSMUST00000226532 1853 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 AL591843.1-201ENSMUST00000223686 3082 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Prg4-208ENSMUST00000164600 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 AC121870.1-201ENSMUST00000216279 4879 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Mmp12-201ENSMUST00000005950 3607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gabra3-202ENSMUST00000114554 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Olfr172-202ENSMUST00000214139 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Mecom-212ENSMUST00000173495 5066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Zfp37-202ENSMUST00000129511 1691 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Akr1c14-202ENSMUST00000118717 3183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Mc2r-201ENSMUST00000052347 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Vmn2r17-201ENSMUST00000171841 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm45066-201ENSMUST00000207528 2551 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Lingo2-210ENSMUST00000164772 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Rgs13-202ENSMUST00000111941 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Ttc39d-201ENSMUST00000053168 2022 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm43498-201ENSMUST00000202002 1486 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Mug-ps1-201ENSMUST00000186891 4386 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Olfr1242-203ENSMUST00000143935 2406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm3286-203ENSMUST00000201629 1945 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm42496-201ENSMUST00000197976 3241 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm6634-201ENSMUST00000180497 1804 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 4930430A15Rik-201ENSMUST00000028577 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 AC120375.1-201ENSMUST00000227034 3612 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 9830107B12Rik-201ENSMUST00000063481 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gbp3-203ENSMUST00000106222 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Ppih-202ENSMUST00000106317 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm22072-201ENSMUST00000116850 121 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm12598-201ENSMUST00000117333 830 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm14794-201ENSMUST00000118181 192 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Mgst1-205ENSMUST00000120939 913 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm23429-201ENSMUST00000122486 149 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm13565-201ENSMUST00000133596 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm23954-201ENSMUST00000157213 353 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm22518-201ENSMUST00000158267 68 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 1700129C05Rik-204ENSMUST00000162674 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Tmem258-204ENSMUST00000166412 447 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Rpl28-ps4-201ENSMUST00000170447 377 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Vmn1r-ps84-201ENSMUST00000172853 923 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Mirt2-201ENSMUST00000175179 285 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 S100a2-201ENSMUST00000179550 315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm8676-201ENSMUST00000184206 637 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
H2-M5A7VMS3 Gm11983-202ENSMUST00000184940 318 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms