Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Scn9a-207ENSMUST00000169900 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Piga-201ENSMUST00000033754 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Olfr753-ps1-204ENSMUST00000219487 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Lpp-202ENSMUST00000078988 15440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Vmn1r35-202ENSMUST00000227346 1854 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 A430027C01Rik-201ENSMUST00000194599 1644 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Bmp15-201ENSMUST00000024049 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Olfr1224-ps1-204ENSMUST00000216833 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Prl2b1-202ENSMUST00000102954 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Hbb-bh2-201ENSMUST00000106866 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm12231-201ENSMUST00000119447 695 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Rps18-ps2-201ENSMUST00000119493 398 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm14516-201ENSMUST00000120012 252 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm5391-201ENSMUST00000121155 613 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Olfr397-201ENSMUST00000121280 1091 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm25103-201ENSMUST00000122671 318 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm15288-201ENSMUST00000126640 653 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 A630023P12Rik-204ENSMUST00000142879 524 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm16345-201ENSMUST00000146065 158 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm23537-201ENSMUST00000157536 330 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm5258-201ENSMUST00000165437 327 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Rps8-ps1-201ENSMUST00000172445 624 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 4930445N18Rik-201ENSMUST00000180631 886 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm9443-201ENSMUST00000188406 816 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm29137-201ENSMUST00000190301 520 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm37815-201ENSMUST00000195665 411 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 BC037156-201ENSMUST00000196993 430 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 4930405G09Rik-201ENSMUST00000207912 1060 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Olfr663-201ENSMUST00000209914 959 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm6906-201ENSMUST00000218014 569 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 AC127279.1-201ENSMUST00000220140 637 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 AC132344.1-201ENSMUST00000221289 376 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 AL589742.1-201ENSMUST00000226034 349 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Mrgprb8-201ENSMUST00000056676 1123 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Magea3-201ENSMUST00000079867 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Mir31-201ENSMUST00000083474 106 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 n-R5s168-201ENSMUST00000083948 104 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Olfr806-201ENSMUST00000095245 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Trpc5os-201ENSMUST00000155206 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm44250-201ENSMUST00000203092 4229 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm17101-201ENSMUST00000169520 1588 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Abcb11-201ENSMUST00000102709 5025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm8989-201ENSMUST00000184782 7275 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Vmn2r43-201ENSMUST00000066317 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Mrgprb2-201ENSMUST00000052730 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Vmn1r37-203ENSMUST00000226886 1308 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Olfr1323-202ENSMUST00000213463 3717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm37356-201ENSMUST00000193362 1613 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm13961-201ENSMUST00000119282 4772 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Olfr270-204ENSMUST00000215127 3145 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Olfr147-202ENSMUST00000214648 5356 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm24124-201ENSMUST00000104103 132 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm12683-201ENSMUST00000117528 415 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Olfr1149-ps1-201ENSMUST00000118232 691 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm11346-201ENSMUST00000118346 704 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm3267-201ENSMUST00000118671 473 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm12735-201ENSMUST00000146218 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm12514-202ENSMUST00000150455 699 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm26347-201ENSMUST00000157526 131 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm22383-201ENSMUST00000158188 327 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Iltifb-201ENSMUST00000163808 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Ctla2b-202ENSMUST00000171347 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm8214-201ENSMUST00000172123 351 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Mir3062-201ENSMUST00000174986 105 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Stx5a-215ENSMUST00000176570 563 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm26828-201ENSMUST00000180640 172 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Trav12-2-201ENSMUST00000180972 426 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Mir6344-201ENSMUST00000183462 104 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 4930540E01Rik-201ENSMUST00000192569 1146 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm8953-201ENSMUST00000198497 904 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm17775-201ENSMUST00000198542 258 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 AC125399.1-201ENSMUST00000224236 595 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 AC159252.1-201ENSMUST00000224450 553 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 AC164116.1-201ENSMUST00000225810 622 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 CT025525.4-201ENSMUST00000227728 277 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Olfr985-202ENSMUST00000214981 1879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Olfr669-202ENSMUST00000210138 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm31747-201ENSMUST00000204638 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Angpt1-201ENSMUST00000022921 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Obscn-202ENSMUST00000047441 24175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm37562-201ENSMUST00000194763 4328 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm15304-201ENSMUST00000122150 2640 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Chl1-203ENSMUST00000203830 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Rfc1-202ENSMUST00000203471 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm16332-201ENSMUST00000134229 2967 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Tcf12-207ENSMUST00000183918 4308 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Ints12-201ENSMUST00000029650 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Ttc33-202ENSMUST00000081640 1583 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Vmn1r71-202ENSMUST00000226874 5194 ntAPPRIS P2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Defb30-201ENSMUST00000100490 307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm8145-201ENSMUST00000118220 745 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Itpa-ps3-201ENSMUST00000119034 395 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm14784-201ENSMUST00000121604 663 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Mir5112-201ENSMUST00000174897 60 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm28703-201ENSMUST00000185312 1159 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Atp8b5A3FIN4 Gm28660-201ENSMUST00000186496 253 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms