Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm3238W4VSP7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm3238W4VSP7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm3238W4VSP7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gm3238W4VSP7 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gm3238W4VSP7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 E130114P18Rik-201ENSMUST00000107067 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3238W4VSP7 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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