Protein–RNA interactions for Protein: V9GX34

Csmd2, CUB and Sushi multiple domains 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd2V9GX34 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Csmd2V9GX34 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csmd2V9GX34 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csmd2V9GX34 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csmd2V9GX34 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csmd2V9GX34 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csmd2V9GX34 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csmd2V9GX34 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csmd2V9GX34 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csmd2V9GX34 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csmd2V9GX34 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csmd2V9GX34 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csmd2V9GX34 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csmd2V9GX34 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csmd2V9GX34 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csmd2V9GX34 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csmd2V9GX34 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csmd2V9GX34 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csmd2V9GX34 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csmd2V9GX34 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Csmd2V9GX34 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csmd2V9GX34 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csmd2V9GX34 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csmd2V9GX34 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csmd2V9GX34 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csmd2V9GX34 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csmd2V9GX34 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csmd2V9GX34 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csmd2V9GX34 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Csmd2V9GX34 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csmd2V9GX34 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csmd2V9GX34 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csmd2V9GX34 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csmd2V9GX34 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csmd2V9GX34 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csmd2V9GX34 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csmd2V9GX34 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csmd2V9GX34 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csmd2V9GX34 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csmd2V9GX34 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csmd2V9GX34 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csmd2V9GX34 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csmd2V9GX34 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Csmd2V9GX34 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csmd2V9GX34 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csmd2V9GX34 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csmd2V9GX34 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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