Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Vstm4T1NXB5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vstm4T1NXB5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms