Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Homer1Q9Z2Y3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Homer1Q9Z2Y3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms