Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hdac5Q9Z2V6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hdac5Q9Z2V6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms