Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krt16Q9Z2K1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt16Q9Z2K1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt16Q9Z2K1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt16Q9Z2K1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt16Q9Z2K1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt16Q9Z2K1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt16Q9Z2K1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt16Q9Z2K1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt16Q9Z2K1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt16Q9Z2K1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt16Q9Z2K1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt16Q9Z2K1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt16Q9Z2K1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt16Q9Z2K1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt16Q9Z2K1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt16Q9Z2K1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt16Q9Z2K1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt16Q9Z2K1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt16Q9Z2K1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt16Q9Z2K1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt16Q9Z2K1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt16Q9Z2K1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms