Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd2Q9Z2E1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd2Q9Z2E1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd2Q9Z2E1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd2Q9Z2E1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd2Q9Z2E1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd2Q9Z2E1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd2Q9Z2E1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd2Q9Z2E1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd2Q9Z2E1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd2Q9Z2E1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mbd2Q9Z2E1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd2Q9Z2E1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd2Q9Z2E1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd2Q9Z2E1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd2Q9Z2E1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd2Q9Z2E1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd2Q9Z2E1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd2Q9Z2E1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd2Q9Z2E1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd2Q9Z2E1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd2Q9Z2E1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd2Q9Z2E1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd2Q9Z2E1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd2Q9Z2E1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd2Q9Z2E1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd2Q9Z2E1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd2Q9Z2E1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd2Q9Z2E1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mbd2Q9Z2E1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd2Q9Z2E1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd2Q9Z2E1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd2Q9Z2E1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd2Q9Z2E1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd2Q9Z2E1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd2Q9Z2E1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd2Q9Z2E1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd2Q9Z2E1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd2Q9Z2E1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd2Q9Z2E1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd2Q9Z2E1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd2Q9Z2E1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd2Q9Z2E1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd2Q9Z2E1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd2Q9Z2E1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd2Q9Z2E1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd2Q9Z2E1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd2Q9Z2E1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd2Q9Z2E1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd2Q9Z2E1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mbd2Q9Z2E1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mbd2Q9Z2E1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms