Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn7Q9Z261 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn7Q9Z261 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn7Q9Z261 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn7Q9Z261 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn7Q9Z261 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn7Q9Z261 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn7Q9Z261 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn7Q9Z261 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn7Q9Z261 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn7Q9Z261 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn7Q9Z261 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn7Q9Z261 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn7Q9Z261 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn7Q9Z261 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn7Q9Z261 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn7Q9Z261 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn7Q9Z261 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cldn7Q9Z261 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn7Q9Z261 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms