Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ilf3Q9Z1X4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms