Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
VarsQ9Z1Q9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
VarsQ9Z1Q9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VarsQ9Z1Q9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VarsQ9Z1Q9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VarsQ9Z1Q9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VarsQ9Z1Q9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VarsQ9Z1Q9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VarsQ9Z1Q9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VarsQ9Z1Q9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VarsQ9Z1Q9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VarsQ9Z1Q9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VarsQ9Z1Q9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VarsQ9Z1Q9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VarsQ9Z1Q9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VarsQ9Z1Q9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VarsQ9Z1Q9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VarsQ9Z1Q9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VarsQ9Z1Q9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VarsQ9Z1Q9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VarsQ9Z1Q9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VarsQ9Z1Q9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VarsQ9Z1Q9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VarsQ9Z1Q9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VarsQ9Z1Q9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VarsQ9Z1Q9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VarsQ9Z1Q9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VarsQ9Z1Q9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VarsQ9Z1Q9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VarsQ9Z1Q9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VarsQ9Z1Q9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VarsQ9Z1Q9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VarsQ9Z1Q9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VarsQ9Z1Q9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VarsQ9Z1Q9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VarsQ9Z1Q9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VarsQ9Z1Q9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VarsQ9Z1Q9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VarsQ9Z1Q9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VarsQ9Z1Q9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VarsQ9Z1Q9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VarsQ9Z1Q9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VarsQ9Z1Q9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VarsQ9Z1Q9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VarsQ9Z1Q9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VarsQ9Z1Q9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VarsQ9Z1Q9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VarsQ9Z1Q9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VarsQ9Z1Q9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms