Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lgr5Q9Z1P4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lgr5Q9Z1P4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms