Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ddx39bQ9Z1N5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ddx39bQ9Z1N5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms