Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cpne6Q9Z140 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpne6Q9Z140 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms