Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NgfrQ9Z0W1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms