Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVB4

Slit3, Slit homolog 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit3Q9WVB4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Slit3Q9WVB4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slit3Q9WVB4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slit3Q9WVB4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slit3Q9WVB4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slit3Q9WVB4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slit3Q9WVB4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slit3Q9WVB4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slit3Q9WVB4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slit3Q9WVB4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slit3Q9WVB4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slit3Q9WVB4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slit3Q9WVB4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slit3Q9WVB4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Slit3Q9WVB4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Slit3Q9WVB4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Slit3Q9WVB4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Slit3Q9WVB4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slit3Q9WVB4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Slit3Q9WVB4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slit3Q9WVB4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slit3Q9WVB4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slit3Q9WVB4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slit3Q9WVB4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slit3Q9WVB4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Slit3Q9WVB4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms