Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme3Q9WV85 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme3Q9WV85 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms