Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Opn3Q9WUK7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Opn3Q9WUK7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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