Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH2

Lhx9, LIM/homeobox protein Lhx9, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx9Q9WUH2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhx9Q9WUH2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhx9Q9WUH2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhx9Q9WUH2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhx9Q9WUH2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhx9Q9WUH2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhx9Q9WUH2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhx9Q9WUH2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhx9Q9WUH2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhx9Q9WUH2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhx9Q9WUH2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhx9Q9WUH2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhx9Q9WUH2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lhx9Q9WUH2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhx9Q9WUH2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhx9Q9WUH2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhx9Q9WUH2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhx9Q9WUH2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhx9Q9WUH2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhx9Q9WUH2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhx9Q9WUH2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhx9Q9WUH2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhx9Q9WUH2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhx9Q9WUH2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhx9Q9WUH2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhx9Q9WUH2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhx9Q9WUH2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhx9Q9WUH2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lhx9Q9WUH2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhx9Q9WUH2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhx9Q9WUH2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhx9Q9WUH2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhx9Q9WUH2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhx9Q9WUH2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhx9Q9WUH2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhx9Q9WUH2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhx9Q9WUH2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lhx9Q9WUH2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lhx9Q9WUH2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms