Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Tnfsf13bQ9WU72 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfsf13bQ9WU72 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfsf13bQ9WU72 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfsf13bQ9WU72 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfsf13bQ9WU72 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfsf13bQ9WU72 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfsf13bQ9WU72 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfsf13bQ9WU72 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfsf13bQ9WU72 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfsf13bQ9WU72 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfsf13bQ9WU72 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfsf13bQ9WU72 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfsf13bQ9WU72 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfsf13bQ9WU72 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfsf13bQ9WU72 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfsf13bQ9WU72 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfsf13bQ9WU72 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfsf13bQ9WU72 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfsf13bQ9WU72 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfsf13bQ9WU72 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfsf13bQ9WU72 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfsf13bQ9WU72 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfsf13bQ9WU72 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfsf13bQ9WU72 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfsf13bQ9WU72 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfsf13bQ9WU72 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfsf13bQ9WU72 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfsf13bQ9WU72 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfsf13bQ9WU72 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfsf13bQ9WU72 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfsf13bQ9WU72 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfsf13bQ9WU72 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfsf13bQ9WU72 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfsf13bQ9WU72 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfsf13bQ9WU72 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfsf13bQ9WU72 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms