Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Pfdn5Q9WU28 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Pfdn5Q9WU28 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Pfdn5Q9WU28 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pfdn5Q9WU28 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pfdn5Q9WU28 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pfdn5Q9WU28 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pfdn5Q9WU28 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pfdn5Q9WU28 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pfdn5Q9WU28 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pfdn5Q9WU28 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pfdn5Q9WU28 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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