Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptpn4Q9WU22 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptpn4Q9WU22 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptpn4Q9WU22 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptpn4Q9WU22 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ptpn4Q9WU22 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ptpn4Q9WU22 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ptpn4Q9WU22 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn4Q9WU22 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms