Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skp1Q9WTX5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Skp1Q9WTX5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms