Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Usp18Q9WTV6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp18Q9WTV6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms